Raziskovalne objave
(Vir: COBISS; Posodobljeno: 10.06.2026)
VEČ OBJAV
2026 – izvirni in pregledni znanstveni članki:
-
-
-
-
- Bacterial microbiome analysis of vaginal, cervical, and endometrial samples in patients with adenomyosis during the window of implantation, Avtorji: Troha, Nika (avtor, korespondenčni avtor); Zorec, Tomaž Mark ; Hošnjak, Lea ; Strašek Smrdel, Katja ; Celar Šturm, Andraž ; Šalamun, Vesna ; Frković-Grazio, Snježana ; Vrtačnik-Bokal, Eda ; Poljak, Mario; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- CAR T therapy in adult DLBCL patients in Slovenia : evaluation of predictive scores for outcomes and adverse events, Sršen, Lucija ; Auersperger, Irena ; Janžič, Larisa ; Kopitar, Andreja Nataša ; Reberšek, Katarina ; Jezeršek Novaković, Barbara ; Novak, Polona ; Rener, Karla ; Šlajpah, Klara ; Ihan, Alojz ; Zver, Samo ; Sever, Matjaž ; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Clinical data on symptomatic cutaneous reinfections due to Borrelia burgdorferi sensu lato in Slovenia, Strle, Franc ; Ogrinc, Katarina ; Maraspin-Čarman, Vera ; Lotrič-Furlan, Stanka ; Rojko, Tereza ;Ružić-Sabljić, Eva ; Kastrin, Andrej ; Strle, Klemen ; Wormser, Gary P. ; Bogovič, Petra ; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Delayed type I interferon response and the subsequent out-of-sequence cytokine signal inhibit T cell induction in non-surviving Ebola virus-infected patients, Zhao, Gang (avtor, korespondenčni avtor); Korva, Miša ; Muñoz-Fontela, César ; Günther, Stephan ; Kerber, Romy ; Binder, Sebastian C. ; Meyer-Hermann, Michael (avtor, korespondenčni avtor); 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Detection and characterization of Sindbis virus genotype IV in mosquitoes from Slovenia, Pozvek, Patricija ; Korva, Miša ; Zakotnik, Samo ; Knapič, Tea ; Adam, Katja ; Resman Rus, Katarina ; Grubelnik, Gašper ; Trilar, Tomi ; Ivović, Vladimir ; Avšič-Županc, Tatjana ; Knap, Nataša; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Emergence of carbapenemase-producing Escherichia coli in acute care hospitals in 32 European countries (the CCRE survey) : a prospective, multicntre, cross-sectional, epidemiological, microbiological, and genomic surveillance study, David, Sophia ; Kohlenberg, Anke ; Yeats, Corin A ; Abu-Dahab, Khalil ; Albiger, Barbara ; Alikhan, Nabil-Fareed ; Alm, Erik ; Byfors, Sara ; Couto, Natacha ; Diaz Caballero, Julio ; Pirš, Mateja; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Emerging human pathogen : identifying Spiroplasma ixodetis as a frequent cause of unlocalised febrile illness, Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); Bogovič, Petra (avtor, korespondenčni avtor); Knap, Nataša ; Kogoj, Rok ; Slunečko, Jan ; Zakotnik, Samo ; Suljič, Alen ; Resman Rus, Katarina ; Pozvek, Patricija ; Strle, Franc ; Avšič-Županc, Tatjana ; Petrovec, Miroslav; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Immune response in dogs with myxomatous mitral valve disease, Cimerman, Martina ; Nemec Svete, Alenka ; Baš, Anže ; Hajdinjak, Melita ; Bajc, Miha ; Petek, Sara ; Pohar, Katka ; Ihan, Alojz ; Krapež, Uroš ; Krt, Branko ; Dolinar, Klemen ; Miš, Katarina ; Pirkmajer, Sergej ; Domanjko-Petrič, Aleksandra; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Impaired booster-induced SARS-CoV-2 antibody responses in rituximab-treated B-cell lymphoma patients despite peripheral B-Cell RecoveryJurca, Tomaž ; Boltežar, Lučka ; Oražem, Miha ; Fujs Komloš, Kristina ; Pohar, Katka ; Jevnikar, Sara ; Poljak, Mario ; Mlakar-Mastnak, Denis ; Rotovnik-Kozjek, Nada ; Vratanar, Bor ; Ocvirk, Janja ; Ihan, Alojz; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Minor non-fermenting Gram-negative bacilli in Europe, 2020-2024 (MINOFEu), Bianco, Gabriele (avtor, korespondenčni avtor); Bastos, Paulo ; Gartzonika, Konstantina ; Christaki, Eirini ; Eirini Mavromanolaki, Viktoria ; Maraki, Sofia ; Spiliopoulou, Anastasia ; Giormezis, Nikolaos ; Lengerova, Gergana ; Kalchev, Yordan ; Pirš, Mateja ; Velimirović, Ivana; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Molecular screening of mosquitoes for filarioid helminths in Slovenia, Glinšek Biškup, Urška ; Knap, Nataša ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Adam, Katja ; Knapič, Tea ; Zakotnik, Samo ; Šoba, Barbara (avtor, korespondenčni avtor) ; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Next generation sequencing approaches for the detection and characterization of enteroviruses in clinical, public health, and research settings : expert view of the European non-polio enterovirus network (ENPEN), Benschop, Kimberley ; Zwagemaker, Florian ; Andersson-Li, Lili ; Galindo de Andrés, Cristina ; Anton, Andres ; Berengua, Carla ; Berginc, Nataša ; Jevšnik Virant, Monika ; Lunar, Maja M. ; Ošep, Anja ; Poljak, Mario; 2026; pregledni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Persistent spread of carbapenemase-producing Klebsiella pneumoniae in acute care hospitals in 36 European countries (the CCRE survey): a prospective, multicentre, cross-sectional, epidemiological, microbiological, and genomic surveillance study, Fröding, Inga ; David, Sophia ; Yeats, Corin A ; Abu-Dahab, Khalil ; Albiger, Barbara ; Alikhan, Nabil-Fareed ; Alm, Erik ; Byfors, Sara ; Couto, Natacha ; Diaz Caballero, Julio ; Pirš, Mateja ; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Postnatal CMV infection in extremely premature newborns [Elektronski vir] : a single-center exploratory study, Košiček, Rok ; Erčulj, Vanja ; Kornhauser-Cerar, Lilijana ; Bregant, Lev ; Petrovec, Miroslav ; Pokorn, Marko ; Spirovska, Ana ; Uršič, Tina ; Rahne-Potokar, Urška ; Grosek, Štefan (avtor, korespondenčni avtor) ; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Predicting the spatio-temporal risk of human tick-borne encephalitis (TBE) in Europe by combining hazard and exposure drivers, Dagostin, Francesca (avtor, korespondenčni avtor); Erazo, Diana ; Marini, Giovanni ; Da Re, Daniele ; Tagliapietra, Valentina ; Avdicova, Maria ; Avšič-Županc, Tatjana ; Dub, Timothée ; Fiorito, Nahuel ; Knap, Nataša; 2026; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
2025 – izvirni in pregledni znanstveni članki:
-
-
-
-
-
- European survey on anaerobes from paediatric blood cultures : ǂa ǂcomparative analysis with adults; Avtorji: Boattini, Matteo ; Aceti, Arianna ; Bastos, Paulo ; Eirini Mavromanolaki, Viktoria ; Maraki, Sofia ; Spiliopoulou, Anastasia ; Kakouris, Vasileios ; Kalchev, Yordan ; Pirš, Mateja ; Velimirović, Ivana; in drugi. ; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- A time series analysis approach to quantify change in antibiotic resistance and antibiotic consumption during COVID-19 epidemics a multicentre cross-national ecological study on behalf of QUantifying change in Antibiotic Resistance, ANTibiotic use, and INfection control during COVID-19 Epidemics study project. Avtorji: Meschiari, Marianna ; López Lozano, José María ; Medioli, Filippo ; Bacca, Erica ; Sarti, Mario ; Pirš, Mateja ; Gregorčič, Sergeja ; Beović, Bojana; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- An outbreak of pulmonary tularemia in Slovenia in summer 2024; Avtorji: Grmek-Košnik, Irena ; Orožen, Kristina ; Ribnikar, Monika ; Grilc, Eva ; Bitežnik, Barbara ; Korva, Miša ; Zdovc, Irena ; Avberšek, Jana ; Vengušt, Gorazd ; Sočan, Maja (avtor, korespondenčni avtor); 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Comparison of Torque teno virus viral load and QuantiFERON Monitor assay and their association with the degree of immunosuppression in kidney transplant patients; Avtorji: Borštnar, Špela ; Večerić-Haler, Željka ; Ponikvar Ležaić, Anja ; Bezeljak, Neva ; Arnol, Miha ; Poljak, Mario ; Lunar, Maja M. ; Mlinšek, Gregor; 2025; izvirni znanstveni članek.
- Čikungunja = Chikungunya; Avtorji; Hafner, Jan ; Korva, Miša ; Kotar, Tadeja; 2025; pregledni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Design, development, and testing of a new multi-locus sequence typing scheme for the zoonotic pathogen Cryptosporidium parvum; Avtorji: Troell, Karin ; Stensvold, Christen Rune ; Sannella, Anna Rosa ; Betson, Martha ; Östlund, Emma ; Chalmers, Rachel M. ; Chaudhry, Umer ; Davidson, Rebecca ; Davies, Lauren ; Ignatius, Ralf ; Šoba, Barbara; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Development and performance evaluation of a clinical metagenomics approach for identifying pathogens in the whole blood from patients with undifferentiated fever; Avtorji: Slunečko, Jan ; Kogoj, Rok ; Zakotnik, Samo ; Suljič, Alen ; Knap, Nataša ; Bosilj, Martin ; Strle, Franc ; Avšič-Županc, Tatjana ; Bogovič, Petra (avtor, korespondenčni avtor); Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Digital PCR outperforms quantitative real-time PCR for the detection and quantification of major periodontal pathobionts; Avtorji: Munjaković, Haris ; Povšič, Katja ; Poljak, Mario ; Seme, Katja ; Gašperšič, Rok ; Skubic, Lucijan ; 2025; izvirni znanstveni članek.
- European human granulocytic anaplasmosis is caused by a subcluster of Anaplasma phagocytophilum Ecotype I ; Avtorji: Lesiczka, Paulina M. ; Loewenich, Friederike D. von ; Kohl, Robert ; Krawczyk, Aleksandra I. ; Dirks, Ron P. ; Boyer, Pierre H. ; Jaulhac, Benoit ; Moniuszko-Malinowska, Anna ; Uršič, Tina ; Strle, Franc ; Lotrič-Furlan, Stanka ; Avšič-Županc, Tatjana ; Petrovec, Miroslav (avtor, korespondenčni avtor); Sprong, Hein; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Investigation of possible intraoperative transmission of Brucella melitensis, Slovenia; Avtorji: Potparić, Igor ; Bošnjak, Klemen ; Avberšek, Jana ; Papić, Bojan ; Bogovič, Petra ; Maver Vodičar, Polona ; Sagadin, Martin ; Pirš, Mateja ; Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); Avšič-Županc, Tatjana ; Vodičar, Miha (avtor, korespondenčni avtor); 2025 ; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Isolation and characterization of two novel oral bacteriophages with anti-biofilm activity against Cutibacterium acnes; Avtorji: Frantar, Anja (avtor, korespondenčni avtor); Seme, Katja ; Gašperšič, Rok ; Oblak, Čedomir ; Šuster, Katja ; 2025; izvirni znanstveni članek.
- Multi-centre clinical validation of the NeuMoDx HPV assay for ASC-US / LSIL triage; Avtorji: Chin, Taeyang; Oštrbenk Valenčak, Anja ; Verhavert, Nick ; Poljak, Mario (avtor, korespondenčni avtor); Padalko, Elizaveta; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Paediatric invasive group A streptococcal infections and associations with viral infections in 15 European countries after lifting non-pharmaceutical interventions against SARS-CoV-2: an interrupted time-series analysis; Avtorji: Lenglart, Léa ; Özmen, Izel ; Aguilera-Alonso, David ; Blazquez-Gamero, Daniel ; Boeddha, Navin P. ; Buddingh, Emilie Pauline ; Buonsenso, Danilo ; Plankar Srovin, Tina ; Vincek, Katarina ; Pokorn, Marko; Seme, Katja ; Velimirović, Ivana; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Phase I trial of phIL12 plasmid intratumoral gene electrotransfer in patients with basal cell carcinoma in head and neck region; Avtorji: Strojan, Primož ; Jesenko, Tanja ; Omerzel, Maša ; Jamšek, Črt ; Grošelj, Aleš ; Lampreht Tratar, Urša ; Markelc, Boštjan ; Gašljević, Gorana ; Ihan, Alojz ; Smrekar, Franc ; Peterka, Matjaž ; Čemažar, Maja ; Serša, Gregor; 2025; izvirni znanstveni članek.
- Phylodynamic inference suggests introductions as main driver of Mpox Clade II outbreak in 2022 in Slovenia; Avtorji: Van der Roest, Bastiaan ; Fischer, Egil A. J. ; Klinkenberg, Don ; Bootsma, Martin C. J. ; Matičič, Mojca ; Resman Rus, Katarina ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Kretzschmar, Mirjam; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Purification and immunogenicity of Nipah virus-like particles from insect cells; Avtorji: Bezeljak, Urban ; Jerman, Alexander ; Brecelj, Tina ; Lokar Kosmač, Martina ; Birsa, Elfi ; Kolenc, Marko ; Déri, Dániel ; Pályi, Bernadett ; Kis, Zoltán ; Peterka, Matjaž; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Safety, long-term effectiveness, and immunogenicity of varicella vaccination in children with juvenile idiopathic arthritis treated with biologic therapy; Avtorji: Bizjak, Maša (avtor, korespondenčni avtor); Peterlin, Jakob ; Avčin, Tadej ; Petrovec, Miroslav ; Ihan, Alojz ; Zajc Avramovič, Mojca ; Markelj, Gašper ; Vesel, Tina ; Osterman, Veronika ; Ahčan, Jerneja ; Mole, Helena ; Dejak Gornik, Katja ; Biteznik, Alenka ; Jevnikar, Sara ; Janžič, Larisa ; Bajc, Miha ; Kopitar, Andreja Nataša ; Toplak, Nataša; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Serological evaluation of Crimean-Congo Hemorrhagic fever in humans with High-Risk professional exposure and in residual sera collected in 2022-2023 across Corsica (France) ; Avtorji: Kiwan, Paloma (avtor, korespondenčni avtor); Gasparine, Morena ; Decarreaux, Dorine ; Capai, Lisandru ; Masse, Shirley ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Canarelli, Jean ; Simeoni, Marie-Helene ; de Lamballerie, Xavier; 2025; izvirni znanstveni članek.
- Sexually transmissible bacterial enteric pathogens; Avtorji: Pirš, Mateja (avtor, korespondenčni avtor); Kotar, Tadeja; 2025; pregledni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Sustained circulation of enterovirus D68 in Europe in 2023 and the continued evolution of enterovirus D68 B3-lineages associated with distinct amino acid substitutions in VP1 protein; Avtorji: Hirvonen, Aurora (avtor, avtor); Johannesen, Caroline K. ; Simmonds, Peter ; Fischer, Thea K ; Benschop, Kimberley ; Berginc, Nataša (927); Lunar, Maja M. (927); Poljak, Mario (927); Petrovec, Miroslav (927); Uršič, Tina (927); 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- The role of focal adhesion kinase in bladder cancer: translation from in vitro to ex vivo human urothelial carcinomas; Avtorji: Markovič, Gaja ; Resnik, Nataša ; Janev, Aleksandar ; Zupančič, Daša ; Grubelnik, Gašper ; Debeljak, Maruša ; Čemažar, Maja ; Jesenko, Tanja ; Omerzel, Maša ; Smrkolj, Tomaž ; Erdani-Kreft, Mateja (avtor, korespondenčni avtor); 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Unveiling the incidences and trends of alveolar echinococcosis in Europe : a systematic review from the KNOW-PATH project; Avtorji: Casulli, Adriano ; Abela-Ridder, Bernadette ; Petrone, Daniele ; Šoba, Barbara ; Dezsényi, Balázs ; Karamon, Jacek ; Millon, Laurence ; Saarma, Urmas ; Antolová, Daniela ; Chappuis, François; 2025; pregledni znanstveni članek.
- Whole genome sequencing and identification of a new subtype of Borrelia lusitaniae from Ixodes ricinus tick in Slovenia; Avtorji: Strašek Smrdel, Katja (avtor, korespondenčni avtor); Celar Šturm, Andraž ; Babič, Alenka ; Ivović, Vladimir ; Ružić-Sabljić, Eva; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Safety, long-term effectiveness, and immunogenicity of varicella vaccination in children with juvenile idiopathic arthritis treated with biologic therapy; Avtorji: Bizjak, Maša (avtor, korespondenčni avtor); Peterlin, Jakob ; Avčin, Tadej ; Petrovec, Miroslav ; Ihan, Alojz ; Zajc Avramovič, Mojca ; Markelj, Gašper ; Vesel, Tina ; Osterman, Veronika ; Ahčan, Jerneja ; Mole, Helena ; Dejak Gornik, Katja ; Biteznik, Alenka ; Jevnikar, Sara ; Janžič, Larisa ; Bajc, Miha ; Kopitar, Andreja Nataša ; Toplak, Nataša. 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Colorimetric RT-LAMP for SARS-CoV-2 detection from nasopharyngeal swabs or crude saliva: a multicountry diagnostic accuracy study in Africa; Avtorji: Šušnjar, Urša ; Bitew, Molalegne ; Ayele, Samuele ; Uršič, Tina ; Petrovec, Miroslav ; Carletti, Tea ; Bussani, Erica ; De Conti, Laura ; Mekonnen, Feleke ; Mandu Baba, Marycelin; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Interspecies transmission and genome heterogeneity of porcine-originated Rotavirus A between domestic pigs and wildlife in the Croatian ecosystem; Avtorji: Kunić, Valentina ; Barbić, Ljubo ; Šimić, Jakob ; Mikuletič, Tina ; Kogoj, Rok ; Koritnik, Tom ; Steyer, Andrej ; Konjević, Dean ; Bujanić, Miljenko ; Prišlin, Marina ; Brnić, Dragan; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Epidemiological changes in Chlamydia pneumoniae molecular detections before, during and after the COVID-19 pandemic in 27 European sites and Taiwan, 2018 to 2023; Avtorji: Tagini, Florian ; Uldum, Søren A ; Berengua, Carla ; Ivan, Branislav ; Capaul, Riccarda ; Edouard, Sophie ; Fischer, Adrien ; Flipse, Jacky ; Martínez de Artola, Diego García ; Goldenberger, Daniel ; Keše, Darja; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Monitoring of sandflies (Diptera: Psychodidae) and pathogen screening in Slovenia with habitat suitability modelling; Avtorji: Ivović, Vladimir ; Glasnović, Peter ; Zupan, Sara ; Knapič, Tea ; Trilar, Tomi ; Korva, Miša ; Knap, Nataša ; Glinšek Biškup, Urška ; Avšič-Županc, Tatjana ; Adam, Katja; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Annual (2024) taxonomic update of RNA-directed RNA polymerase-encoding negative-sense RNA viruses (realm Riboviria: kingdom Orthornavirae: phylum Negarnaviricota); Avtorji: Kuhn, Jens H. ; Adkins, Scott ; Alkhovsky, Sergey V. ; An, Wenxia ; Avšič-Županc, Tatjana ; Ayllón, María A. ; Bačnik, Katarina ; Bahl, Justin ; Balkema-Buschmann, Anne ; Ballinger, Matthew J. ; Gutiérrez-Aguirre, Ion ; Kutnjak, Denis ; Mehle, Nataša ; Pecman, Anja ; Ravnikar, Maja ; Vučurović, Ana ; 2025; pregledni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Development of multivalent SARS-CoV-2 virus-like particle vaccine candidates; Avtorji: Bezeljak, Urban ; Jerman, Alexander ; Kobal, Tina ; Birsa, Elfi ; Lokar Kosmač, Martina ; Žiberna, Rok ; Lokar, Krista ; Janež, Nikolaja ; Ravlić, Sanda ; Halassy, Beata ; Kolenc, Marko ; Triglav, Tina ; Hostnik, Urška ; Horvat, Simon ; Peterka, Matjaž; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Assessment of three criteria to establish borrelial infection in suspected lyme neuroborreliosis; Avtorji: Ogrinc, Katarina ; Bogovič, Petra ; Maraspin-Čarman, Vera ; Lotrič-Furlan, Stanka ; Rojko, Tereza ; Ružić-Sabljić, Eva ; Kastrin, Andrej ; Strle, Klemen ; Wormser, Gary P. ; Strle, Franc; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Bioinformatic challenges in metagenomic next generation sequencing data analysis while unravelling a case of uncommon campylobacteriosis; Avtorji: Kogoj, Rok ; Bosilj, Martin ; Celar Šturm, Andraž ; Korva, Miša ; Strašek Smrdel, Katja ; Kvas, Eva ; Pirš, Mateja ; Lepen, Lidija (avtor, korespondenčni avtor); Triglav, Tina; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Exhausted natural killer cells in adult IgA vasculitis; Avtorji: Bajželj, Matija ; Senjor, Emanuela ; Boštic, Nika ; Hladnik, Matjaž ; Sodin-Šemrl, Snežna ; Perišić, Milica ; Kos, Janko ; Ihan, Alojz ; Hočevar, Alojzija ; Kopitar, Andreja Nataša ; Lakota, Katja; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Gene therapy of rare diseases as a milestone in medicine [Elektronski vir] : overview of the field and report on initial experiences in Slovenia; Avtorji: Grošelj, Urh ; Kavčič, Marko ; Drole Torkar, Ana ; Kafol, Jan ; Lainšček, Duško ; Jerala, Roman ; Sever, Matjaž ; Zver, Samo ; Serša, Gregor ; Čemažar, Maja ; Strojan, Primož ; Grošelj, Aleš ; Žerjav-Tanšek, Mojca ; Miroševič, Špela ; Ivančan, Simona ; Prelog, Tomaž ; Gosar, David ; Oražem, Jasna ; Mlinarič, Matej ; Bertok, Sara ; Kovač, Jernej ; Kodrič, Jana ; Battelino, Saba ; Pokorn, Marko ; Ihan, Alojz ; Jazbec, Janez ; Battelino, Tadej ; Osredkar, Damjan; 2025; pregledni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Safety, long-term effectiveness, and immunogenicity of varicella vaccination in children with juvenile idiopathic arthritis treated with biologic therapy; Avtorji: Bizjak, Maša (avtor, korespondenčni avtor); Peterlin, Jakob ; Avčin, Tadej ; Petrovec, Miroslav ; Ihan, Alojz ; Zajc Avramovič, Mojca ; Markelj, Gašper ; Vesel, Tina ; Osterman, Veronika ; Ahčan, Jerneja ; Mole, Helena ; Dejak Gornik, Katja ; Biteznik, Alenka ; Jevnikar, Sara ; Janžič, Larisa ; Bajc, Miha ; Kopitar, Andreja Nataša ; Toplak, Nataša; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Sustained circulation of enterovirus D68 in Europe in 2023 and the continued evolution of enterovirus D68 B3-lineages associated with distinct amino acid substitutions in VP1 protein; Avtorji: Hirvonen, Aurora ; Johannesen, Caroline K. ; Simmonds, Peter ; Fischer, Thea K ; Benschop, Kimberley ; Berginc, Nataša ; Lunar, Maja M. ; Poljak, Mario ; Petrovec, Miroslav ; Uršič, Tina ; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Serological evaluation of Crimean-Congo Hemorrhagic fever in humans with High-Risk professional exposure and in residual sera collected in 2022-2023 across Corsica (France); Avtorji: Kiwan, Paloma (avtor, korespondenčni avtor); Gasparine, Morena ; Decarreaux, Dorine ; Capai, Lisandru ; Masse, Shirley ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Canarelli, Jean ; Simeoni, Marie-Helene ; de Lamballerie, Xavier; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Interactions between the pathogenic fungus Cryptococcus neoformans and ants; Avtorji: Cogliati, Massimo ; Akçağlar, Sevim ; Tore, Okan ; Matos, Tadeja ; Tomazin, Rok ; Zdovc, Irena ; Pllana, Donjeta ; Escandon, Patricia ; Epis, Sara ; Cattaneo, Giulia Maria ; Serio, Francesca; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Broth microdilution protocol for determining antimicrobial susceptibility of Legionella pneumophila to clinically relevant antimicrobials; Avtorji: Sewell, Max ; Farley, Caitlin ; Portal, Edward A. R. ; Lindsay, Diane ; Ricci, Maria Luisa ; Jarraud, Sophie ; Scaturro, Maria ; Descours, Ghislaine ; Vatland Krøvel, Anne ; Barton, Rachael ; Keše, Darja; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Diagnostic and epidemiological landscape of anaerobic bacteria in Europe, 2020-2023 (ANAEuROBE); Avtorji: Boattini, Matteo ; Bianco, Gabriele ; Bastos, Paulo ; Eirini Mavromanolaki, Viktoria ; Maraki, Sofia ; Spiliopoulou, Anastasia ; Kakouris, Vasileios ; Kalchev, Yordan ; Budimir, Ana ; Bedenić, Branka ; Pirš, Mateja; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Electrolyzed saline prevents virus transmission in dental procedures: an in vitro study; Avtorji: Munjaković, Haris ; Mikuletič, Tina ; Zayed, N. ; Kolenc, Marko ; Manevski, D. ; Triglav, Tina ; Steyer, Andrej ; Teughels, W. ; Seme, Katja ; Fidler, Aleš ; Gašperšič, Rok; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Global spatiotemporal dynamics of Mycoplasma pneumoniae re-emergence after COVID-19 pandemic restrictions [Elektronski vir] : an epidemiological and transmission modelling study; Avtorji: Meyer Sauteur, Patrick M. (avtor, korespondenčni avtor); Zhang, Xu-Sheng ; Emborg, Hanne-Dorthe ; Sidorov, Semjon ; Pereyre, Sabine ; Fischer, Adrien ; Lemaire, Baptiste ; Greub, Gilbert ; Zimmermann, Petra Sophia ; Agyeman, Philipp K. A. ; Keše, Darja; 2025; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Phase I trial of phIL12 plasmid intratumoral gene electrotransfer in patients with basal cell carcinoma in head and neck region; Avtorji: Strojan, Primož ; Jesenko, Tanja ; Omerzel, Maša ; Jamšek, Črt ; Grošelj, Aleš ; Lampreht Tratar, Urša ; Markelc, Boštjan ; Gašljević, Gorana ; Ihan, Alojz ; Smrekar, Franc ; Peterka, Matjaž ; Čemažar, Maja ; Serša, Gregor; 2025; izvirni znanstveni članek.
2024 – izvirni in pregledni znanstveni članki:
-
-
-
-
- Pseudomonas aeruginosa antimicrobial susceptibility profiles, resistance mechanisms and international clonal lineages : update from ESGARS-ESCMID/ISARPAE Group; Oliver, Antonio ; Rojo-Molinero, Estrella ; Arca-Suarez, Jorge ; Beşli, Yeşim ; Bogaerts, Pierre ; Cantón, Rafael ; Cimen, Cansu ; Croughs, Peter D ; Denis, Olivier ; Pirš, Mateja; 2024; pregledni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Antimicrobial-resistant Neisseria gonorrhoeae in Europe in 2020 compared with in 2013 and 2018: a retrospective genomic surveillance study; Avtorji: Golparian, Daniel ; Cole, Michelle ; Sánchez-Busó, Leonor ; Day, Michaela J. ; Jacobsson, Susanne ; Uthayakumaran, Thinushaa ; Abad, Raquel ; Bercot, Beatrice ; Caugant, Dominique A. ; Heuer, Dagmar ; Kustec, Tanja (927); Maver Vodičar, Polona (927); 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Diarrheagenic Escherichia coli in stool specimens collected from patients attending primary healthcare facilities in Ethiopia: whole-genome sequencing-based molecular characterization; Avtorji: Deneke, Wolde ; Eguale, Tadesse ; Medhin, Girmay ; Haile, Aklilu Feleke ; Alemayehu, Haile ; Mihret, Adane ; Pirš, Mateja ; Strašek Smrdel, Katja ; Avberšek, Jana ; Kušar, Darja ; Cerar Kišek, Tjaša ; Janko, Tea ; Steyer, Andrej ; Starčič Erjavec, Marjanca; 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Article genomic characterization of extended-spectrum β-lactamase-producing and third-generation cephalosporin-resistant Escherichia coli isolated from stools of primary healthcare patients in Ethiopia; Avtorji: Deneke, Wolde ; Eguale, Tadesse ; Medhin, Girmay ; Haile, Aklilu Feleke ; Alemayehu, Haile ; Mihret, Adane ; Pirš, Mateja ; Strašek, Katja ; Avberšek, Jana ; Kušar, Darja ; Cerar Kišek, Tjaša ; Janko, Tea ; Steyer, Andrej ; Starčič Erjavec, Marjanca; 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Criteria for second generation comparator tests in validation of novel HPV DNA tests for use in cervical cancer screening; Avtorji: Arbyn, Marc (avtor, korespondenčni avtor); Cuschieri, Kate S. ; Bonde, Jesper ; Schuurman, Rob ; Cocuzza, Clementina ; Vanden Broeck, Davy ; Zhao, Fang-Hui ; Rezhake, Remila ; Gultekin, Murat ; de Sanjosé, Silvia ; Poljak, Mario; 2024; pregledni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Enrichment of SARS-CoV-2 sequence from nasopharyngeal swabs whilst identifying the nasal microbiome; Avtorji: Alrezoihi, Abdulrahman ; Penrice-Randal, Rebekah ; Dong, Xiaofeng ; Prince, Tessa ; Randle, Nadine ; Zakotnik, Samo ; Suljič, Alen ; Avšič-Županc, Tatjana ; Petrovec, Miroslav ; Korva, Miša; 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Knockouts of CYP51A1, DHCR24, or SC5D from cholesterol synthesis reveal pathways modulated by sterol intermediates; Avtorji: Skubic, Cene ; Trček, Hana ; Nassib, Petra ; Kreft, Tinkara ; Walakira, Andrew ; Pohar, Katka ; Petek, Sara ; Režen, Tadeja ; Ihan, Alojz ; Rozman, Damjana (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Validation of the clinical performance and reproducibility of the NeuMoDx HPV assay self-sample workflow; Avtorji: Heideman, Daniëlle A. M. (avtor, korespondenčni avtor); Berkhof, Johannes ; Verhoef, Linda P.B. ; Ouwerkerk, Cor ; Smit, P. W. ; Oštrbenk Valenčak, Anja ; Mlakar Jernej; Poljak, Mario ; Steenbergen, Renske D. M. ; Bleeker, M. C. G.; 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Tick-borne encephalitis vaccine breakthrough infections induce aberrant T cell and antibody responses to non-structural proteins; Avtorji: Aregay, Amare ; Slunečko, Jan ; Korva, Miša ; Bogovič, Petra ; Resman Rus, Katarina ; Knap, Nataša ; Beicht, Jana ; Kubinski, Mareike ; Saletti, Giulietta ; Avšič-Županc, Tatjana ; Strle, Franc; 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Human papillomavirus negative high grade cervical lesions and cancers: suggested guidance for HPV testing quality assurance; Avtorji: Prétet, Jean Luc ; Arroyo Mühr, Laila Sara ; Cuschieri, Kate S. ; Fellner, María Dolores ; Correa, Rita Mariel ; Picconi, María Alejandra ; Garland, Suzanne M. ; Murray, Gerald L. ; Molano, Monica ; Peeters, Michael ; Poljak, Mario; 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Comparison of culture-dependent and culture-independent methods for routine identification of airborne microorganisms in speleotherapeutic caves; Avtorji; Tomazin, Rok ; Cerar Kišek, Tjaša ; Janko, Tea ; Triglav, Tina ; Strašek, Katja ; Špik, Vesna ; Kukec, Andreja ; Mulec, Janez ; Matos, Tadeja (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Influenza A, Influenza B, human respiratory syncytial virus and SARSCoV-2 molecular diagnostics and epidemiology in the post COVID-19 era; Luštrek, Manca ; Prestor, Zala ; Suljič, Alen ; Kogoj, Rok ; Knap, Nataša ; Jevšnik Virant, Monika ; Uršič, Tina ; Petrovec, Miroslav ; Avšič-Županc, Tatjana ; Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Efficient SARS-CoV-2 variant detection and monitoring with Spike Screen next-generation sequencing; Suljič, Alen ; Zorec, Tomaž Mark ; Zakotnik, Samo ; Vlaj, Doroteja ; Kogoj, Rok ; Knap, Nataša ; Petrovec, Miroslav ; Poljak, Mario ; Avšič-Županc, Tatjana ; Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Sequencing analysis of SARS-CoV-2 cases in Slovenian long-term care facilities to support outbreak control; Kogoj, Rok ;Grašek, Manja ; Suljič, Alen ; Zakotnik, Samo ; Vlaj, Doroteja ; Kotnik Koman, Kaja ; Fafangel, Mario ; Petrovec, Miroslav ; Avšič-Županc, Tatjana ; Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Review of virological methods for laboratory diagnosis and characterization of monkeypox virus (MPXV) : lessons learned from the 2022 Mpox outbreak; Resman Rus, Katarina ;Zakotnik, Samo ; Sagadin, Martin ; Kolenc, Marko ; Skubic, Lucijan ; Knap, Nataša ; Korva, Miša ; Poljak, Mario ; Avšič-Županc, Tatjana (avtor, korespondenčni avtor); 2024; pregledni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Herpesviridae and atypical bacteria co-detections in lower respiratory tract samples of SARS-CoV-2-positive patients admitted to an intensive care unit; Grubelnik, Gašper ;Korva, Miša ; Kogoj, Rok ; Polanc, Tina ; Mavrič, Matej ; Jevšnik Virant, Monika ; Uršič, Tina ; Keše, Darja ; Seme, Katja ; Petrovec, Miroslav ; Jereb, Matjaž ; Avšič-Županc, Tatjana (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Elevated levels of serum muscle enzymes in the initial phase of tick-borne encephalitis; Bogovič, Petra (avtor, korespondenčni avtor); Lotrič-Furlan, Stanka ; Ogrinc, Katarina ; Avšič-Županc, Tatjana ;Korva, Miša ; Kastrin, Andrej ; Trampuš-Bakija, Alenka ; Strle, Klemen ; Strle, Franc; 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Plectin plays a role in the migration and volume regulation of astrocytes : a potential biomarker of glioblastoma; Avtorji: Žugec, Maja ; Furlani, Borut ; Castañón, Maria J. ; Rituper, Boštjan ; Fischer, Irmgard ; Broggi, Giuseppe ; Caltabiano, Rosario ; Barbagallo, Giuseppe M. V. ; Di Rosa, Michelino ; Tibullo, Daniele ; Simčič, Saša ; Stokin, Gorazd Bernard ; Jorgačevski, Jernej ; Zorec, Robert ; Potokar, Maja (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Poor virus-specific T-cell responses early after tick-borne encephalitis virus infection correlate with disease severity; Avtorji: Aregay, Amare ; Slunečko, Jan ;Bogovič, Petra ; Korva, Miša ; Resman Rus, Katarina ; Knap, Nataša ; Beicht, Jana ; Kubinski, Mareike ; Saletti, Giulietta ; Steffen, Imke ; Strle, Franc ; Avšič-Županc, Tatjana; 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Prospective longitudinal study of dynamics of human papillomavirus 6 and 11 infection in anogenital hairs and eyebrows of male patients with anogenital warts and age-matched controls; Avtorji: Tlaker Žunter, Vesna ;Hošnjak, Lea ; Kolenc, Mateja ; Zorec, Tomaž Mark ; Luzar, Boštjan ; Potočnik, Marko ; Miljković, Jovan ; Seme, Katja ; Poljak, Mario (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- The impact of COVID-19 on multidrug-resistant bacteria at a Slovenian tertiary medical center; Avtorji: Mrvič, Tatjana ; Stevanoska, Sintija ; Beović, Bojana ; Logar, Mateja ; Gregorčič, Sergeja ; Žnidaršič, Benica; Seme, Katja ; Velimirović, Ivana ; Švent-Kučina, Nataša ; Maver Vodičar, Polona ; Križan-Hergouth, Veronika ; Džeroski, Sašo ; Pirš, Mateja; 2024; izvirni znanstveni članek.
2023 – izvirni in pregledni znanstveni članki:
-
-
-
-
- Alterations in immunophenotype and metabolic profile of mononuclear cells during follow up in children with multisystem inflammatory syndrome (MIS-C); Avtorji: Kopitar, Andreja Nataša ;Repas, Jernej ; Janžič, Larisa ; Bizjak, Maša ; Vesel, Tina ; Emeršič, Nina ; Zajc Avramovič, Mojca ; Ihan, Alojz ; Avčin, Tadej ; Pavlin, Mojca; 2023; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Association of persistent symptoms after lyme neuroborreliosis and Increased levels of interferon-α in blood; Avtorji: Hernández, Sergio A. ; Ogrinc, Katarina ;Korva, Miša ; Kastrin, Andrej ; Bogovič, Petra ; Rojko, Tereza ; Kelley, Keith W. ; Weis, Janis J ; Strle, Franc ; Strle, Klemen; 2023; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Atypical skull-base osteomyelitis: comprehensive review and multidisciplinary management viewpoints; Avtorji: Urbančič, Jure ;Vozel, Domen; Battelino, Saba ; Bošnjak, Roman ; Kokošar Ulčar, Barbara ; Matos, Tadeja ; Munda, Matic ; Papst, Lea ; Steiner, Nejc ; Vouk, Matej ; Zidar, Nina; 2023; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Characterisation of the Antibody Response in Sinopharm (BBIBP-CorV) recipients and COVID-19 Convalescent Sera from the Republic of Moldova; Avtorji: Ulinici, Mariana ; Suljič, Alen ;Poggianella, Monica ; Bonotto, Rafaela ; Resman Rus, Katarina ; Paraschiv, Angela ; Bonetti, Amedeo Marco ; Todiras, Mihail ; Corlateanu, Alexandru ; Petrovec, Miroslav; 2023; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- FAM19A4/miR124-2 methylation testing and human papillomavirus (HPV) 16/18 genotyping in HPV-positive women under the age of 30 years; Avtorji: Vink, Frederique J. ; Meijer, Chris J.L.M. ; Hesselink, Albertus ; Floore, Arno N. ; Lissenberg-Witte, Birgit I. ; Bonde, Jesper ; Pedersen, Helle ; Cuschieri, Kate S. ; Poljak, Mario ;Oštrbenk Valenčak, Anja; 2023; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- First expert elicitation of knowledge on possible drivers of observed increasing human cases of tick-borne encephalitis in Europe; Avtorji: Saegerman, Claude ; Humblet, Marie-France ; Leandri, Marc ; Gonzalez, Gaëlle ; Heyman, Paul ; Sprong, Hein ; L’Hostis, Monique ; Moutailler, Sara ; Knap, Nataša ;Avšič-Županc, Tatjana; 2023; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- High incidence of multisystem inflammatory syndrome and other autoimmune diseases after SARS-CoV-2 infection compared to COVID-19 vaccination in children and adolescents in south central Europe; Avtorji: Bizjak, Maša ; Emeršič, Nina ;Zajc Avramovič, Mojca ; Vesel, Tina ; Mlakar, G. ; Berce, Vojko ; Markelj, Gašper ; Plankar Srovin, Tina ; Golli, Tanja ; Osredkar, Damjan ; Koren, Anja ; Toplak, Nataša ; Pokorn, Marko ; Avšič-Županc, Tatjana ; Ihan, Alojz ; Fafangel, Mario ; Avčin, Tadej; 2023; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- HIV-1 subtype B spread through cross-border clusters in the Balkans : a molecular analysis in view of incidence trends; Avtorji: Jovanovic, Luka ; Siljic, Marina ; Cirkovic, Valentina ; Salemovic, Dubravka ; Jevtovic, Djordje ; Alexiev, Ivailo ; Židovec-Lepej, Snježana ; Poljak, Mario ;Lunar, Maja M. ; Stanojevic, Maja; 2023; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Impact of the COVID-19 pandemic on community consumption of antibiotics for systemic use and resistance of invasive streptococcus pneumoniae in Slovenia; Avtorji: Kastrin, Tamara ;Mioč, Verica ; Mahnič, Aleksander ; Čižman, Milan ; Velimirović, Ivana; Bombek, Maja; Lugovski, Marica; Ribič, Helena; Grmek-Košnik, Irena; Jeverica, Samo; Juriševič Dodič, Anamarija; Todorović, Aleksandar; Berce, Ingrid; Piltaver-Vajdec, Irena; Lužnik, Dane; Stojoska Surbanovska, Tanja; 2023; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Interspecies transmission of porcine-originated G4P[6] rotavirus A between pigs and humans: a synchronized spatiotemporal approach; Avtorji: Kunić, Valentina ; Mikuletič, Tina ;Kogoj, Rok ; Koritnik, Tom ; Steyer, Andrej ; Šoprek, Silvija ; Tešović, Goran ; Konjik, Vlatka ; Roksandić Križan, Ivana ; Prišlin, Marina; 2023; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Intrahost monkeypox virus genome variation in patient with early infection, Finland, 2022; Avtorji: Vauhkonen, Hanna ; Kallio-Kokko, Hannimari ; Hiltunen-Back, Eija ; Lönnqvist, Lasse ; Leppäaho-Lakka, Jaana ; Zorec, Tomaž Mark ;Zakotnik, Samo ; Vlaj, Doroteja ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Poljak, Mario; 2023; drugi znanstveni članki.
-
-
-
-
- Molecular typing of mastadenoviruses in simultaneously collected nasopharyngeal swabs and stool samples from children hospitalized for acute bronchiolitis, acute gastroenteritis, and febrile seizures; Avtorji: Glinšek Biškup, Urška ;Steyer, Andrej ; Lusa, Lara ; Strle, Franc ; Pokorn, Marko ; Mrvič, Tatjana ; Grosek, Štefan ; Petrovec, Miroslav ; Jevšnik Virant, Monika; 2023; izvirni znanstveni članek.
-
-
-
-
- Osnove mikrobiologije za študente laboratorijske biomedicine; Avtorji: Glinšek Biškup, Urška (avtor, urednik);Jevšnik Virant, Monika (avtor, urednik); Krošelj, Manca (ilustrator); Petrovec, Miroslav (recenzent); Ružić-Sabljić, Eva (fotograf, recenzent); Pirš, Mateja (fotograf); Šoba, Barbara (fotograf); Sagadin, Martin (fotograf); Kolenc, Marko (fotograf); 2023; univerzitetni učbenik z recenzijo.
-
-
-
-
- Securing wider EU commitment to the elimination of hepatitis C virus; Avtorji: Wedemeyer, Heiner ; Tergast, Tammo L ; Lazarus, Jeffrey V. ; Razavi, Homie ; Bakoyannis, Kostas ; Baptista-Leite, Ricardo ; Bartoli, Marco ; Bruggmann, Philip ; Busoi, Cristian-Silviu ; Buti, Maria ; Carballo, Manuel ; Matičič, Mojca ;Poljak, Mario; 2023; pregledni znanstveni članek.
-
-
- Unveiling the incidences and trends of the neglected zoonosis cystic echinococcosis in Europe : a systematic review from the MEmE project; Avtorji: Casulli, Adriano ; Abela-Ridder, Bernadette ; Petrone, Daniele ; Fabiani, Maks ; Bobić, Branko ; Carmena, David ; Šoba, Barbara ;Zerem, Enver ; João Gargaté, Maria ; Kuzmanovska, Gordana; in sod.; 2023; pregledni znanstveni članek.
