V stodevetinštirideseto (149.) presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 65 vzorcev (84 % vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 19. 09. 2024 in 30. 09. 2024. Izmed teh je bilo 55 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, 10 % iz Gorenjske regije, 7 % iz Jugovzhodne regije, 6 % iz Podravske regije, 4 % iz Goriške regije, po 3 % iz Koroške, Obalno-kraške ter Zasavske regije in po 1 % iz Pomurske, Primorsko-notranjske ter Savinjske regije. Dva vzorca sta pripadala osebama, ki imata stalno prebivališče v tujini.
Zaradi stabilne epidemiološke situacije, ECDC od 3. marca 2023 na seznam zaskrbljujočih variant (»Variants of Concern« – VOC) trenutno ne uvršča nobenih linij SARS-CoV-2.
V stodevetinštiridesetem presejalnem sekveniranju, ki zajema obdobje od 18. 09. 2024 do 30. 09. 2024, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.
Slika 1. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v obdobju med 19. 09. 2024 in 30. 09. 2024. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu ³ 2 %. Srednji in notranji obroč prikazujeta različna nivoja starševskih linij.
Agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji na spletu
Od julija 2024 je kot plod sodelovanja Nacionalnega inštituta za javno zdravje (NIJZ), Inštituta za mikrobiologijo in imunologijo (IMI) ter Nacionalnega laboratorija za zdravje, okolje in hrano (NLZOH) na spletu na voljo agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2, kjer se v realnem času zbirajo in osvežujejo podatki laboratorijev, ki izvajamo sekvenciranje. Na voljo je splošni pregled količine sekvenciranih vzorcev, dokazane različice in število VOC, VOI in VUM.
Povezava do spletnega mesta: Spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji