V stopetdeseto (150.) presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 88 vzorcev (81 % vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 01. 10. 2024 in 13. 10. 2024. Izmed teh je bilo 61 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, po 7 % iz Goriške, Jugovzhodne ter Zasavske regije, 5 % iz Pomurske regije, po 3 % iz Gorenjske, Podravske ter Savinjske regije, 2 % iz Obalno-kraške regije in 1 % iz Koroške regije. Vzorcev oseb s stalnim prebivališčem v tujini ni bilo.
Zaradi stabilne epidemiološke situacije, ECDC od 3. marca 2023 na seznam zaskrbljujočih variant (»Variants of Concern« – VOC) trenutno ne uvršča nobenih linij SARS-CoV-2.
V stopetdesetem presejalnem sekveniranju, ki zajema obdobje od 01. 10. 2024 do 13. 10. 2024, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.
Slika 1. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v obdobju med 01. 10. 2024 in 13. 10. 2024. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu ³ 2 %. Srednji in notranji obroč prikazujeta različna nivoja starševskih linij.
Agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji na spletu
Od julija 2024 je kot plod sodelovanja Nacionalnega inštituta za javno zdravje (NIJZ), Inštituta za mikrobiologijo in imunologijo (IMI) ter Nacionalnega laboratorija za zdravje, okolje in hrano (NLZOH) na spletu na voljo agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2, kjer se v realnem času zbirajo in osvežujejo podatki laboratorijev, ki izvajamo sekvenciranje. Na voljo je splošni pregled količine sekvenciranih vzorcev, dokazane različice in število VOC, VOI in VUM.
Povezava do spletnega mesta: Spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji