Raziskovalna dejavnost

Raziskovalne objave

(Vir: COBISS; Posodobljeno: 30.01.2026)

VEČ OBJAV

2026 – izvirni in pregledni znanstveni članki:

• • • • • • An open-label randomized controlled trial comparing the efficacy and safety of a 7-day triple therapy with bismuth versus 14-day standard triple therapy for Helicobacter pylori eradication in children and adolescents; Avtorji: Šterbenc, Anja ;  Vratanar, Bor ; Miler Mojškerc, Eva ; Homan, Matjaž (avtor, korespondenčni avtor); 2026; izvirni znanstveni članek.

• • • • • Syndromic molecular testing in mechanically ventilated patients with severe pneumonia : a supportive diagnostic approach; Avtorji: Uršič, Tina (avtor, korespondenčni avtor); Erzar, Kaja ; Seme, Katja ;  Jereb, Matjaž ; Strle, Franc ; Petrovec, Miroslav; 2026; izvirni znanstveni članek.
          

2025 – izvirni in pregledni znanstveni članki:

• • • • • • Expression of the stem cell markers NANOG and SOX2 in the cervical squamous carcinogenesis; Avtorji: Koren, Miha (avtor, korespondenčni avtor); Žlajpah, Margareta; Poljak, Mario; Fujs Komloš, Kristina ; Strojan Fležar, Margareta. 2025; izvirni znanstveni članek.

• • • • • Epidemiological and clinical insights into enterovirus circulation in Europe, 2018 – 2023: a multi-center retrospective surveillance study; Avtorji: Schrijver, Sten de ; Vanhulle, Emiel ; Ingenbleek, Anne ; Alexakis, Leonidas ; Berginc, Nataša ; Lunar, Maja M. ; Poljak, Mario. 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • European survey on anaerobes from paediatric blood cultures : ǂa ǂcomparative analysis with adults; Avtorji: Boattini, Matteo ; Aceti, Arianna ; Bastos, Paulo ; Eirini Mavromanolaki, Viktoria ; Maraki, Sofia ; Spiliopoulou, Anastasia ; Kakouris, Vasileios ; Kalchev, Yordan ; Pirš, Mateja ; Velimirović, Ivana; in drugi. ; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • A time series analysis approach to quantify change in antibiotic resistance and antibiotic consumption during COVID-19 epidemics a multicentre cross-national ecological study on behalf of QUantifying change in Antibiotic Resistance, ANTibiotic use, and INfection control during COVID-19 Epidemics study project. Avtorji: Meschiari, Marianna ; López Lozano, José María ; Medioli, Filippo ; Bacca, Erica ; Sarti, Mario ; Pirš, Mateja ; Gregorčič, Sergeja ; Beović, Bojana; 2025; izvirni znanstveni članek.
            

   

  • • • • • An outbreak of pulmonary tularemia in Slovenia in summer 2024; Avtorji: Grmek-Košnik, Irena ; Orožen, Kristina ; Ribnikar, Monika ; Grilc, Eva ; Bitežnik, Barbara ; Korva, Miša ; Zdovc, Irena ; Avberšek, Jana ; Vengušt, Gorazd ; Sočan, Maja (avtor, korespondenčni avtor); 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Clinical factors in SARS-CoV-2 antibody response in unvaccinated mothers; Avtorji: Druškovič, Mirjam ;  Kavšek, Gorazd ; Mesarič, Vita Andreja ; Štrukelj, Aleksandra ; Avšič-Županc, Tatjana ; Ihan, Alojz ;  Premru-Sršen, Tanja ; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Comparison of Torque teno virus viral load and QuantiFERON Monitor assay and their association with the degree of immunosuppression in kidney transplant patients; Avtorji: Borštnar, Špela ;  Večerić-Haler, Željka ; Ponikvar Ležaić, Anja ; Bezeljak, Neva ; Arnol, Miha ; Poljak, Mario ; Lunar, Maja M. ;  Mlinšek, Gregor; 2025; izvirni znanstveni članek.
          • Čikungunja = Chikungunya; Avtorji; Hafner, Jan ; Korva, Miša ;  Kotar, Tadeja; 2025; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Design, development, and testing of a new multi-locus sequence typing scheme for the zoonotic pathogen Cryptosporidium parvum; Avtorji: Troell, Karin ; Stensvold, Christen Rune ; Sannella, Anna Rosa ; Betson, Martha ; Östlund, Emma ; Chalmers, Rachel M. ; Chaudhry, Umer ; Davidson, Rebecca ; Davies, Lauren ; Ignatius, Ralf ; Šoba, Barbara; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Development and performance evaluation of a clinical metagenomics approach for identifying pathogens in the whole blood from patients with undifferentiated fever; Avtorji: Slunečko, Jan ; Kogoj, Rok ; Zakotnik, Samo ; Suljič, Alen ; Knap, Nataša ;  Bosilj, Martin ; Strle, Franc ; Avšič-Županc, Tatjana ;  Bogovič, Petra (avtor, korespondenčni avtor); Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Digital PCR outperforms quantitative real-time PCR for the detection and quantification of major periodontal pathobionts; Avtorji: Munjaković, Haris ; Povšič, Katja ; Poljak, Mario ; Seme, Katja ; Gašperšič, Rok ; Skubic, Lucijan ; 2025; izvirni znanstveni članek.
          • European human granulocytic anaplasmosis is caused by a subcluster of Anaplasma phagocytophilum Ecotype I ; Avtorji: Lesiczka, Paulina M. ; Loewenich, Friederike D. von ; Kohl, Robert ; Krawczyk, Aleksandra I. ; Dirks, Ron P. ; Boyer, Pierre H. ; Jaulhac, Benoit ; Moniuszko-Malinowska, Anna ; Uršič, Tina ; Strle, Franc ; Lotrič-Furlan, Stanka ; Avšič-Županc, Tatjana ; Petrovec, Miroslav (avtor, korespondenčni avtor); Sprong, Hein; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Human papillomavirus (HPV) genotyping and prognostic value of HPV E4 protein and transcription factors NANOG and SOX11 in atypical p16 patchy squamous epithelium of cervix; Avtorji: Kebe Radulović, Maja (avtor, korespondenčni avtor); Oštrbenk Valenčak, Anja ; Poljak, Mario ;  Strojan Fležar, Margareta; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Influenza C virus in children with acute bronchiolitis and febrile seizures; Avtorji: Jevšnik Virant, Monika; Petrovec, Miroslav ; Strle, Franc ; Mrvič, Tatjana ; Pokorn, Marko ; Grosek, Štefan ; Uršič, Tina; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Investigation of possible intraoperative transmission of Brucella melitensis, Slovenia; Avtorji: Potparić, Igor ; Bošnjak, Klemen ; Avberšek, Jana ; Papić, Bojan ; Bogovič, Petra ; Maver Vodičar, Polona ; Sagadin, Martin ; Pirš, Mateja ; Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); Avšič-Županc, Tatjana ; Vodičar, Miha (avtor, korespondenčni avtor); 2025 ; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Isolation and characterization of two novel oral bacteriophages with anti-biofilm activity against Cutibacterium acnes; Avtorji: Frantar, Anja (avtor, korespondenčni avtor); Seme, Katja ; Gašperšič, Rok ; Oblak, Čedomir ; Šuster, Katja ; 2025; izvirni znanstveni članek.
          • Multi-centre clinical validation of the NeuMoDx HPV assay for ASC-US / LSIL triage; Avtorji: Chin, Taeyang; Oštrbenk Valenčak, Anja ; Verhavert, Nick ; Poljak, Mario (avtor, korespondenčni avtor); Padalko, Elizaveta; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Paediatric invasive group A streptococcal infections and associations with viral infections in 15 European countries after lifting non-pharmaceutical interventions against SARS-CoV-2: an interrupted time-series analysis; Avtorji: Lenglart, Léa ; Özmen, Izel ; Aguilera-Alonso, David ; Blazquez-Gamero, Daniel ; Boeddha, Navin P. ; Buddingh, Emilie Pauline ; Buonsenso, Danilo ; Plankar Srovin, Tina ; Vincek, Katarina ; Pokorn, Marko; Seme, Katja ; Velimirović, Ivana; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Phase I trial of phIL12 plasmid intratumoral gene electrotransfer in patients with basal cell carcinoma in head and neck region; Avtorji: Strojan, Primož ; Jesenko, Tanja ; Omerzel, Maša ; Jamšek, Črt ; Grošelj, Aleš ; Lampreht Tratar, Urša ; Markelc, Boštjan ; Gašljević, Gorana ; Ihan, Alojz ; Smrekar, Franc ; Peterka, Matjaž ; Čemažar, Maja ; Serša, Gregor; 2025; izvirni znanstveni članek.
          • Phylodynamic inference suggests introductions as main driver of Mpox Clade II outbreak in 2022 in Slovenia; Avtorji: Van der Roest, Bastiaan ; Fischer, Egil A. J. ; Klinkenberg, Don ; Bootsma, Martin C. J. ; Matičič, Mojca ; Resman Rus, Katarina ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Kretzschmar, Mirjam; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Prevalence of high-risk human papillomaviruses (HPV) in Slovenian women attending organized National Cervical Cancer Screening 14 years after implementation of the National HPV Vaccination Program; Avtorji: Lasič Pecev, Mateja ; Oštrbenk Valenčak, Anja ; Smrkolj, Špela ; Bohinc, Klara ; Pflaum, Ana ; Poljak, Mario (avtor, korespondenčni avtor); 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Proportion of confirmed Lyme neuroborreliosis cases among adult patients with suspected early European Lyme neuroborreliosis; Avtorji: Ogrinc, Katarina ; Bogovič, Petra ; Rojko, Tereza ; Maraspin-Čarman, Vera ; Ružić-Sabljić, Eva ; Kastrin, Andrej ; Strle, Klemen ; Wormser, Gary P. ; Strle, Franc; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Purification and immunogenicity of Nipah virus-like particles from insect cells; Avtorji: Bezeljak, Urban ; Jerman, Alexander ; Brecelj, Tina ; Lokar Kosmač, Martina ; Birsa, Elfi ; Kolenc, Marko ; Déri, Dániel ; Pályi, Bernadett ; Kis, Zoltán ; Peterka, Matjaž; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Safety, long-term effectiveness, and immunogenicity of varicella vaccination in children with juvenile idiopathic arthritis treated with biologic therapy; Avtorji: Bizjak, Maša (avtor, korespondenčni avtor); Peterlin, Jakob ; Avčin, Tadej ; Petrovec, Miroslav ; Ihan, Alojz ; Zajc Avramovič, Mojca ; Markelj, Gašper ; Vesel, Tina ; Osterman, Veronika ; Ahčan, Jerneja ; Mole, Helena ; Dejak Gornik, Katja ; Biteznik, Alenka ; Jevnikar, Sara ; Janžič, Larisa ; Bajc, Miha ; Kopitar, Andreja Nataša ; Toplak, Nataša; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Senescent polarization of macrophages and inflammatory biomarkers in cardiovascular disease; Avtorji: Ihan, Alojz; 2025; pregledni znanstveni članek.
          • Sequencing of chemotherapy in total neoadjuvant treatment for rectal cancer does not predict radiation-induced lymphopenia; Avtorji: Oražem, Miha ; Velenik, Vaneja ; Ihan, Alojz; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Serological evaluation of Crimean-Congo Hemorrhagic fever in humans with High-Risk professional exposure and in residual sera collected in 2022-2023 across Corsica (France) ; Avtorji: Kiwan, Paloma (avtor, korespondenčni avtor); Gasparine, Morena ; Decarreaux, Dorine ; Capai, Lisandru ; Masse, Shirley ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Canarelli, Jean ; Simeoni, Marie-Helene ; de Lamballerie, Xavier; 2025; izvirni znanstveni članek.
          • Sexually transmissible bacterial enteric pathogens; Avtorji: Pirš, Mateja (avtor, korespondenčni avtor); Kotar, Tadeja; 2025; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Sustained circulation of enterovirus D68 in Europe in 2023 and the continued evolution of enterovirus D68 B3-lineages associated with distinct amino acid substitutions in VP1 protein; Avtorji: Hirvonen, Aurora (avtor, avtor); Johannesen, Caroline K. ; Simmonds, Peter ; Fischer, Thea K ; Benschop, Kimberley ; Berginc, Nataša (927); Lunar, Maja M. (927); Poljak, Mario (927); Petrovec, Miroslav (927); Uršič, Tina (927); 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Temocillin: a narrative review of its clinical reappraisal; Avtorji: Cosimi, Lavinia ; Zerbato, Verena ; Grasselli Kmet, Nina ; Oliva, Alessandra ; Cogliati Dezza, Francesco ; Nadrah, Kristina ; Pirš, Mateja ; Saletinger, Rajko; 2025; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • The Allplex HPV HR Detection assay fulfils international guideline requirements for primary cervical screening on SurePath samples and qualifies as a second-generation HPV comparator test; Avtorji: Oštrbenk Valenčak, Anja (avtor, korespondenčni avtor); Pedersen, Helle ; Poljak, Mario ; Bonde, Jesper; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • The role of focal adhesion kinase in bladder cancer: translation from in vitro to ex vivo human urothelial carcinomas; Avtorji: Markovič, Gaja ; Resnik, Nataša ; Janev, Aleksandar ; Zupančič, Daša ; Grubelnik, Gašper ; Debeljak, Maruša ; Čemažar, Maja ; Jesenko, Tanja ; Omerzel, Maša ; Smrkolj, Tomaž ; Erdani-Kreft, Mateja (avtor, korespondenčni avtor); 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Unveiling the incidences and trends of alveolar echinococcosis in Europe : a systematic review from the KNOW-PATH project; Avtorji: Casulli, Adriano ; Abela-Ridder, Bernadette ; Petrone, Daniele ; Šoba, Barbara ; Dezsényi, Balázs ; Karamon, Jacek ; Millon, Laurence ; Saarma, Urmas ; Antolová, Daniela ; Chappuis, François; 2025; pregledni znanstveni članek.
          • Whole genome sequencing and identification of a new subtype of Borrelia lusitaniae from Ixodes ricinus tick in Slovenia; Avtorji: Strašek Smrdel, Katja (avtor, korespondenčni avtor); Celar Šturm, Andraž ; Babič, Alenka ; Ivović, Vladimir ; Ružić-Sabljić, Eva; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Safety, long-term effectiveness, and immunogenicity of varicella vaccination in children with juvenile idiopathic arthritis treated with biologic therapy; Avtorji: Bizjak, Maša (avtor, korespondenčni avtor); Peterlin, Jakob ; Avčin, Tadej ; Petrovec, Miroslav ; Ihan, Alojz ; Zajc Avramovič, Mojca ; Markelj, Gašper ; Vesel, Tina ; Osterman, Veronika ; Ahčan, Jerneja ; Mole, Helena ; Dejak Gornik, Katja ; Biteznik, Alenka ; Jevnikar, Sara ; Janžič, Larisa ; Bajc, Miha ; Kopitar, Andreja Nataša ; Toplak, Nataša. 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Sequencing of chemotherapy in total neoadjuvant treatment for rectal cancer does not predict radiation-induced lymphopenia; Avtorji: Oražem, Miha ; Velenik, Vaneja ; Ihan, Alojz; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Colorimetric RT-LAMP for SARS-CoV-2 detection from nasopharyngeal swabs or crude saliva: a multicountry diagnostic accuracy study in Africa; Avtorji: Šušnjar, Urša ; Bitew, Molalegne ; Ayele, Samuele ; Uršič, Tina ; Petrovec, Miroslav ; Carletti, Tea ; Bussani, Erica ; De Conti, Laura ; Mekonnen, Feleke ; Mandu Baba, Marycelin; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Interspecies transmission and genome heterogeneity of porcine-originated Rotavirus A between domestic pigs and wildlife in the Croatian ecosystem; Avtorji: Kunić, Valentina ; Barbić, Ljubo ; Šimić, Jakob ; Mikuletič, Tina ; Kogoj, Rok ; Koritnik, Tom ; Steyer, Andrej ; Konjević, Dean ; Bujanić, Miljenko ; Prišlin, Marina ; Brnić, Dragan; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Epidemiological changes in Chlamydia pneumoniae molecular detections before, during and after the COVID-19 pandemic in 27 European sites and Taiwan, 2018 to 2023; Avtorji: Tagini, Florian ; Uldum, Søren A ; Berengua, Carla ; Ivan, Branislav ; Capaul, Riccarda ; Edouard, Sophie ; Fischer, Adrien ; Flipse, Jacky ; Martínez de Artola, Diego García ; Goldenberger, Daniel ; Keše, Darja; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Monitoring of sandflies (Diptera: Psychodidae) and pathogen screening in Slovenia with habitat suitability modelling; Avtorji: Ivović, Vladimir ; Glasnović, Peter ; Zupan, Sara ; Knapič, Tea ; Trilar, Tomi ; Korva, Miša ; Knap, Nataša ; Glinšek Biškup, Urška ; Avšič-Županc, Tatjana ; Adam, Katja; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Whole genome sequencing and identification of a new subtype of Borrelia lusitaniae from Ixodes ricinus tick in Slovenia; Avtorji: Strašek Smrdel, Katja (avtor, korespondenčni avtor); Celar Šturm, Andraž ; Babič, Alenka ; Ivović, Vladimir ; Ružić-Sabljić, Eva; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Acute human bocavirus 1 infection in children hospitalized for acute bronchiolitis : a 2-year prospective study; Avtorji: Uršič, Tina; Lusa, Lara; Strle, Franc; Pokorn, Marko; Mrvič, Tatjana; Grosek, Štefan; Petrovec, Miroslav; Jevšnik Virant, Monika: 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Annual (2024) taxonomic update of RNA-directed RNA polymerase-encoding negative-sense RNA viruses (realm Riboviria: kingdom Orthornavirae: phylum Negarnaviricota); Avtorji: Kuhn, Jens H. ; Adkins, Scott ; Alkhovsky, Sergey V. ; An, Wenxia ; Avšič-Županc, Tatjana ; Ayllón, María A. ; Bačnik, Katarina ; Bahl, Justin ; Balkema-Buschmann, Anne ; Ballinger, Matthew J. ; Gutiérrez-Aguirre, Ion ; Kutnjak, Denis ; Mehle, Nataša ; Pecman, Anja ; Ravnikar, Maja ; Vučurović, Ana ; 2025; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Development of multivalent SARS-CoV-2 virus-like particle vaccine candidates; Avtorji: Bezeljak, Urban ; Jerman, Alexander ; Kobal, Tina ; Birsa, Elfi ; Lokar Kosmač, Martina ; Žiberna, Rok ; Lokar, Krista ; Janež, Nikolaja ; Ravlić, Sanda ; Halassy, Beata ; Kolenc, Marko ; Triglav, Tina ; Hostnik, Urška ; Horvat, Simon ; Peterka, Matjaž; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Assessment of three criteria to establish borrelial infection in suspected lyme neuroborreliosis; Avtorji: Ogrinc, Katarina ; Bogovič, Petra ; Maraspin-Čarman, Vera ; Lotrič-Furlan, Stanka ; Rojko, Tereza ; Ružić-Sabljić, Eva ; Kastrin, Andrej ; Strle, Klemen ; Wormser, Gary P. ; Strle, Franc; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Bioinformatic challenges in metagenomic next generation sequencing data analysis while unravelling a case of uncommon campylobacteriosis; Avtorji: Kogoj, Rok ; Bosilj, Martin ; Celar Šturm, Andraž ; Korva, Miša ; Strašek Smrdel, Katja ; Kvas, Eva ; Pirš, Mateja ; Lepen, Lidija (avtor, korespondenčni avtor); Triglav, Tina; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Exhausted natural killer cells in adult IgA vasculitis; Avtorji: Bajželj, Matija ; Senjor, Emanuela ; Boštic, Nika ; Hladnik, Matjaž ; Sodin-Šemrl, Snežna ; Perišić, Milica ; Kos, Janko ; Ihan, Alojz ; Hočevar, Alojzija ; Kopitar, Andreja Nataša ; Lakota, Katja; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Expression of the stem cell markers NANOG and SOX2 in the cervical squamous carcinogenesis; Avtorji: Koren, Miha (avtor, korespondenčni avtor); Žlajpah, Margareta ; Poljak, Mario ; Fujs Komloš, Kristina ; Strojan Fležar, Margareta; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Gene therapy of rare diseases as a milestone in medicine [Elektronski vir] : overview of the field and report on initial experiences in Slovenia; Avtorji: Grošelj, Urh ; Kavčič, Marko ; Drole Torkar, Ana ; Kafol, Jan ; Lainšček, Duško ; Jerala, Roman ; Sever, Matjaž ; Zver, Samo ; Serša, Gregor ; Čemažar, Maja ; Strojan, Primož ; Grošelj, Aleš ; Žerjav-Tanšek, Mojca ; Miroševič, Špela ; Ivančan, Simona ; Prelog, Tomaž ; Gosar, David ; Oražem, Jasna ; Mlinarič, Matej ; Bertok, Sara ; Kovač, Jernej ; Kodrič, Jana ; Battelino, Saba ; Pokorn, Marko ; Ihan, Alojz ; Jazbec, Janez ; Battelino, Tadej ; Osredkar, Damjan; 2025; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Proportion of confirmed Lyme neuroborreliosis cases among adult patients with suspected early European Lyme neuroborreliosis; Avtorji: Ogrinc, Katarina ; Bogovič, Petra ; Rojko, Tereza ; Maraspin-Čarman, Vera ; Ružić-Sabljić, Eva ; Kastrin, Andrej ; Strle, Klemen ; Wormser, Gary P. ; Strle, Franc; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Safety, long-term effectiveness, and immunogenicity of varicella vaccination in children with juvenile idiopathic arthritis treated with biologic therapy; Avtorji: Bizjak, Maša (avtor, korespondenčni avtor); Peterlin, Jakob ; Avčin, Tadej ; Petrovec, Miroslav ; Ihan, Alojz ; Zajc Avramovič, Mojca ; Markelj, Gašper ; Vesel, Tina ; Osterman, Veronika ; Ahčan, Jerneja ; Mole, Helena ; Dejak Gornik, Katja ; Biteznik, Alenka ; Jevnikar, Sara ; Janžič, Larisa ; Bajc, Miha ; Kopitar, Andreja Nataša ; Toplak, Nataša; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Sustained circulation of enterovirus D68 in Europe in 2023 and the continued evolution of enterovirus D68 B3-lineages associated with distinct amino acid substitutions in VP1 protein; Avtorji: Hirvonen, Aurora ; Johannesen, Caroline K. ; Simmonds, Peter ; Fischer, Thea K ; Benschop, Kimberley ; Berginc, Nataša ; Lunar, Maja M. ; Poljak, Mario ; Petrovec, Miroslav ; Uršič, Tina ; 2025; izvirni znanstveni članek.
  • • • • • Sexually transmissible bacterial enteric pathogens; Avtorji: Pirš, Mateja (avtor, korespondenčni avtor); Kotar, Tadeja; 2025; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Serological evaluation of Crimean-Congo Hemorrhagic fever in humans with High-Risk professional exposure and in residual sera collected in 2022-2023 across Corsica (France); Avtorji:  Kiwan, Paloma (avtor, korespondenčni avtor); Gasparine, Morena ; Decarreaux, Dorine ; Capai, Lisandru ; Masse, Shirley ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Canarelli, Jean ; Simeoni, Marie-Helene ; de Lamballerie, Xavier; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Interactions between the pathogenic fungus Cryptococcus neoformans and ants; Avtorji: Cogliati, Massimo ; Akçağlar, Sevim ; Tore, Okan ; Matos, Tadeja ; Tomazin, Rok ; Zdovc, Irena ; Pllana, Donjeta ; Escandon, Patricia ; Epis, Sara ; Cattaneo, Giulia Maria ; Serio, Francesca; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Broth microdilution protocol for determining antimicrobial susceptibility of Legionella pneumophila to clinically relevant antimicrobials; Avtorji: Sewell, Max ; Farley, Caitlin ; Portal, Edward A. R. ; Lindsay, Diane ; Ricci, Maria Luisa ; Jarraud, Sophie ; Scaturro, Maria ; Descours, Ghislaine ; Vatland Krøvel, Anne ; Barton, Rachael ; Keše, Darja; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Addressing viral hepatitis C reinfections in a low-threshold programme for people who inject drugs in Slovenia; Avtorji: Černoša, Jasna (avtor, korespondenčni avtor); Meglič-Volkar, Jelka ; Poljak, Mario ; Pohar Perme, Maja ; Lazarus, Jeffrey Victor ; Matičič, Mojca; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Diagnostic and epidemiological landscape of anaerobic bacteria in Europe, 2020-2023 (ANAEuROBE); Avtorji: Boattini, Matteo ; Bianco, Gabriele ; Bastos, Paulo ; Eirini Mavromanolaki, Viktoria ; Maraki, Sofia ; Spiliopoulou, Anastasia ; Kakouris, Vasileios ; Kalchev, Yordan ; Budimir, Ana ; Bedenić, Branka ; Pirš, Mateja; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Electrolyzed saline prevents virus transmission in dental procedures: an in vitro study; Avtorji: Munjaković, Haris ; Mikuletič, Tina ; Zayed, N. ; Kolenc, Marko ; Manevski, D. ; Triglav, Tina ; Steyer, Andrej ; Teughels, W. ; Seme, Katja ; Fidler, Aleš ; Gašperšič, Rok; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Global spatiotemporal dynamics of Mycoplasma pneumoniae re-emergence after COVID-19 pandemic restrictions [Elektronski vir] : an epidemiological and transmission modelling study; Avtorji: Meyer Sauteur, Patrick M. (avtor, korespondenčni avtor); Zhang, Xu-Sheng ; Emborg, Hanne-Dorthe ; Sidorov, Semjon ; Pereyre, Sabine ; Fischer, Adrien ; Lemaire, Baptiste ; Greub, Gilbert ; Zimmermann, Petra Sophia ; Agyeman, Philipp K. A. ; Keše, Darja; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Clinically validated HPV assays offer comparable long-term safety in primary cervical cancer screening : a 9-year follow-up of a population-based screening cohort; Avtorji: Oštrbenk Valenčak, Anja ; Kroon, Kelsi R. ; Fabjan, Danijela ; Mlakar, Jana ; Seme, Katja ; Berkhof, Johannes ; Poljak, Mario (avtor, korespondenčni avtor); 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Mononuclear aluminum-fluoride ions, AlF[sub]x[sup]((+/−)) – study of plausible frameworks of complexes with biomolecules and their in vitro toxicity; Avtorji: Pavlovič, Anja ; Janžič, Larisa ; Sršen, Lucija ; Kopitar, Andreja Nataša ; Edwards, Kathleen F. ; Liebman, Joel F. ; Ponikvar-Svet, Maja; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Phase I trial of phIL12 plasmid intratumoral gene electrotransfer in patients with basal cell carcinoma in head and neck region; Avtorji: Strojan, Primož ; Jesenko, Tanja ; Omerzel, Maša ; Jamšek, Črt ; Grošelj, Aleš ; Lampreht Tratar, Urša ; Markelc, Boštjan ; Gašljević, Gorana ; Ihan, Alojz ; Smrekar, Franc ; Peterka, Matjaž ; Čemažar, Maja ; Serša, Gregor; 2025; izvirni znanstveni članek.

   

  2024 – izvirni in pregledni znanstveni članki:

   

  • • • • • Pseudomonas aeruginosa antimicrobial susceptibility profiles, resistance mechanisms and international clonal lineages : update from ESGARS-ESCMID/ISARPAE Group; Oliver, Antonio ; Rojo-Molinero, Estrella ; Arca-Suarez, Jorge ; Beşli, Yeşim ; Bogaerts, Pierre ; Cantón, Rafael ; Cimen, Cansu ; Croughs, Peter D ; Denis, Olivier ; Pirš, Mateja; 2024; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Canid alphaherpesvirus 1 infection alters the gene expression and secretome profile of canine adipose-derived mesenchymal stem cells in vitro; Avtorji: Prišlin Šimac, Marina ; Naletilić Šimun ; Kostanić, Vjekoslava ; Kunić, Valentina ; Zorec, Tomaž Mark ; Poljak, Mario ; Vlaj, Doroteja ; Kogoj, Rok ; Turk, Nenad ; Brnić, Dragan; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • MetaAll: integrative bioinformatics workflow for analysing clinical metagenomic data; Avtorji: Bosilj, Martin ; Suljič, Alen ; Zakotnik, Samo ; Slunečko, Jan ; Kogoj, Rok ; Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Long-term infection with a particular human papillomavirus (HPV) genotype, HPV Subtype, or HPV genomic variant does not significantly influence the clinical course of recurrent Respiratory Papillomatosis; Avtorji: Gluvajić, Daša ; Hošnjak, Lea ; Zorec, Tomaž Mark ; Gale, Nina ; Hočevar-Boltežar, Irena ; Poljak, Mario (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Immune response to SARS-CoV-2 in vaccine-naive pregnant women: assessment of IgG and IgA antibody profile at delivery and 42 days postpartum; Avtorji: Druškovič, Mirjam ; Lučovnik, Miha ; Mesarič, Vita Andreja ; Kavšek, Gorazd ; Vidmar Šimic, Marijana ; Trojner-Bregar, Andreja ; Avšič-Županc, Tatjana ; Ihan, Alojz ; Premru-Sršen, Tanja; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Antimicrobial-resistant Neisseria gonorrhoeae in Europe in 2020 compared with in 2013 and 2018: a retrospective genomic surveillance study; Avtorji: Golparian, Daniel ; Cole, Michelle ; Sánchez-Busó, Leonor ; Day, Michaela J. ; Jacobsson, Susanne ; Uthayakumaran, Thinushaa ; Abad, Raquel ; Bercot, Beatrice ; Caugant, Dominique A. ; Heuer, Dagmar ; Kustec, Tanja (927); Maver Vodičar, Polona (927); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Diarrheagenic Escherichia coli in stool specimens collected from patients attending primary healthcare facilities in Ethiopia: whole-genome sequencing-based molecular characterization; Avtorji: Deneke, Wolde ; Eguale, Tadesse ; Medhin, Girmay ; Haile, Aklilu Feleke ; Alemayehu, Haile ; Mihret, Adane ; Pirš, Mateja ; Strašek Smrdel, Katja ; Avberšek, Jana ; Kušar, Darja ; Cerar Kišek, Tjaša ; Janko, Tea ; Steyer, Andrej ; Starčič Erjavec, Marjanca; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Inflammatory and immune variables as predictors of survival in dogs with myxomatous mitral valve disease; Avtorji: Cimerman, Martina ; Druzhaeva, N. ; Nemec Svete, Alenka ; Hajdinjak, Melita ; Pohar, Katka ; Ihan, Alojz ; Domanjko-Petrič, Aleksandra; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Physiologically achievable concentration of 2-deoxy-D-glucose stimulates IFN-γ secretion in activated T cells in vitro; Avtorji: Repas, Jernej ; Frlic, Tjaša ; Snedec, Tadeja ; Kopitar, Andreja Nataša ; Sourij, Harald ; Janež, Andrej ; Pavlin, Mojca (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Article genomic characterization of extended-spectrum β-lactamase-producing and third-generation cephalosporin-resistant Escherichia coli isolated from stools of primary healthcare patients in Ethiopia; Avtorji: Deneke, Wolde ; Eguale, Tadesse ; Medhin, Girmay ; Haile, Aklilu Feleke ; Alemayehu, Haile ; Mihret, Adane ; Pirš, Mateja ; Strašek, Katja ; Avberšek, Jana ; Kušar, Darja ; Cerar Kišek, Tjaša ; Janko, Tea ; Steyer, Andrej ; Starčič Erjavec, Marjanca; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Combinatory effect of nitroxoline and gentamicin in the control of uropathogenic enterococci infections; Avtorji: Repac Antić, Davorka ; Kovač, Bruno ; Kolenc, Marko ; Brčić Karačonji, Irena ; Gobin, Ivana ; Petković Didović, Mirna; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Criteria for second generation comparator tests in validation of novel HPV DNA tests for use in cervical cancer screening; Avtorji: Arbyn, Marc (avtor, korespondenčni avtor); Cuschieri, Kate S. ; Bonde, Jesper ; Schuurman, Rob ; Cocuzza, Clementina ; Vanden Broeck, Davy ; Zhao, Fang-Hui ; Rezhake, Remila ; Gultekin, Murat ; de Sanjosé, Silvia ; Poljak, Mario; 2024; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Enrichment of SARS-CoV-2 sequence from nasopharyngeal swabs whilst identifying the nasal microbiome; Avtorji: Alrezoihi, Abdulrahman ; Penrice-Randal, Rebekah ; Dong, Xiaofeng ; Prince, Tessa ; Randle, Nadine ; Zakotnik, Samo ; Suljič, Alen ; Avšič-Županc, Tatjana ; Petrovec, Miroslav ; Korva, Miša; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Increasing fluroquinolone susceptibility and genetic diversity of ESBL-producing E. coli from the lower respiratory tract during the COVID-19 pandemic. Avtorji: Hrovat, Katja ; Seme, Katja ; Ambrožič, Jerneja; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Knockouts of CYP51A1, DHCR24, or SC5D from cholesterol synthesis reveal pathways modulated by sterol intermediates; Avtorji: Skubic, Cene ; Trček, Hana ; Nassib, Petra ; Kreft, Tinkara ; Walakira, Andrew ; Pohar, Katka ; Petek, Sara ; Režen, Tadeja ; Ihan, Alojz ; Rozman, Damjana (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Serological response after COVID-19 infection compared to vaccination against COVID-19 in children with autoimmune rheumatic diseases; Avtorji: Šinkovec Savšek, Tjaša ; Zajc Avramovič, Mojca ; Avčin, Tadej ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Toplak, Nataša; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Validation of the clinical performance and reproducibility of the NeuMoDx HPV assay self-sample workflow; Avtorji: Heideman, Daniëlle A. M. (avtor, korespondenčni avtor); Berkhof, Johannes ; Verhoef, Linda P.B. ; Ouwerkerk, Cor ; Smit, P. W. ; Oštrbenk Valenčak, Anja ; Mlakar Jernej; Poljak, Mario ; Steenbergen, Renske D. M. ; Bleeker, M. C. G.; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Tick-borne encephalitis vaccine breakthrough infections induce aberrant T cell and antibody responses to non-structural proteins; Avtorji: Aregay, Amare ; Slunečko, Jan ; Korva, Miša ; Bogovič, Petra ; Resman Rus, Katarina ; Knap, Nataša ; Beicht, Jana ; Kubinski, Mareike ; Saletti, Giulietta ; Avšič-Županc, Tatjana ; Strle, Franc; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Mycological methods for routine air sampling and interpretation of results in operating theaters; Avtorji: Tomazin, Rok ; Matos, Tadeja (avtor, korespondenčni avtor); 2024; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Molecular epidemiology and characterization of enteroviruses detected in cerebrospinal fluid andrespiratory samples in Slovenia, 2014–2023; Avtorji: Berginc, Nataša ; Lunar, Maja M. ; Šramel, Nina ; Poljak, Mario; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Human papillomavirus negative high grade cervical lesions and cancers: suggested guidance for HPV testing quality assurance; Avtorji: Prétet, Jean Luc ; Arroyo Mühr, Laila Sara ; Cuschieri, Kate S. ; Fellner, María Dolores ; Correa, Rita Mariel ; Picconi, María Alejandra ; Garland, Suzanne M. ; Murray, Gerald L. ; Molano, Monica ; Peeters, Michael ; Poljak, Mario; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Effect of castration method on porcine skeletal muscle fiber traits and transcriptome profiles; Avtorji: Poklukar Žnidaršič, Klavdija ; Erbežnik, Anja ; Fazarinc, Gregor ; Kress, Kevin ; Batorek Lukač, Nina ; Škrlep, Martin ; Stefanski, Volker ; Čandek-Potokar, Marjeta ; Vrecl, Milka; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • DNA methylation as a triage tool for cervical cancer screening: a meeting report; Avtorji: Burdier, F. Ricardo Burdier ; Waheed, Dur-E-Nayab ; Nedjai, Belinda ; Steenbergen, Renske D. M. ; Poljak, Mario ; Baay, Marc ; Vorsters, Alex (avtor, korespondenčni avtor); Van Keer, Severien; 2024; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Comparison of culture-dependent and culture-independent methods for routine identification of airborne microorganisms in speleotherapeutic caves; Avtorji; Tomazin, Rok ; Cerar Kišek, Tjaša ; Janko, Tea ; Triglav, Tina ; Strašek, Katja ; Špik, Vesna ; Kukec, Andreja ; Mulec, Janez ; Matos, Tadeja (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • A novel digital PCR assay for detection and comprehensive characterization of Molluscum contagiosum virus genotypes MOCV1, MOCV2, and MOCV3 and recombinant lineages; Avtorji: Zorec, Tomaž Mark ; Skubic, Lucijan ; Poljak, Mario (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Prevalence of Helicobacter pylori infection among Slovenian children and adolescents : a prospective cohort study; Šterbenc, Anja ; Godnov, Uroš ; Maver Vodičar, Polona ; Simčič, Saša ; Jeverica, Samo ; Zaletel, Živa ; Homan, Pia ; Miler Mojškerc, Eva; Homan, Matjaž; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Influenza A, Influenza B, human respiratory syncytial virus and SARSCoV-2 molecular diagnostics and epidemiology in the post COVID-19 era; Luštrek, Manca ; Prestor, Zala ; Suljič, Alen ; Kogoj, Rok ; Knap, Nataša ; Jevšnik Virant, Monika ; Uršič, Tina ; Petrovec, Miroslav ; Avšič-Županc, Tatjana ; Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Efficient SARS-CoV-2 variant detection and monitoring with Spike Screen next-generation sequencing; Suljič, Alen ; Zorec, Tomaž Mark ; Zakotnik, Samo ; Vlaj, Doroteja ; Kogoj, Rok ; Knap, Nataša ; Petrovec, Miroslav ; Poljak, Mario ; Avšič-Županc, Tatjana ; Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Whole genome sequencing and molecular epidemiology of methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolated from patients with bacteraemia in Slovenia; Dermota, Urška (avtor, korespondenčni avtor);Celar Šturm, Andraž ; Triglav, Tina ; Strašek, Katja ; Velimirović, Ivana; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Sequencing analysis of SARS-CoV-2 cases in Slovenian long-term care facilities to support outbreak control; Kogoj, Rok ;Grašek, Manja ; Suljič, Alen ; Zakotnik, Samo ; Vlaj, Doroteja ; Kotnik Koman, Kaja ; Fafangel, Mario ; Petrovec, Miroslav ; Avšič-Županc, Tatjana ; Korva, Miša (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Prirojena okužba s citomegalovirusom = Congenital cytomegalovirus infection : priporočila za usmerjeno presejanje novorojenčkov in protokol obravnave = recommendations for targeted newborn screening and follow-up protocol; Eržen, Nika ; Korpar, Bojan ;Markelj, Špela ; Golli, Tanja ; Stropnik, Staša ; Grosek, Štefan ; Petrovec, Miroslav ; Paro Panjan, Darja ; Nosan, Gregor; 2024; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Effects of speleotherapy on aerobiota: a case study from the Sežana hospital cave, Slovenia; Tomazin, Rok ;Kukec, Andreja ; Švigelj, Viktor ; Mulec, Janez ; Matos, Tadeja; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Allplex HPV HR detection assay fulfils all clinical performance and reproducibility validation requirements for primary cervical cancer screening; Oštrbenk Valenčak, Anja ;Cuschieri, Kate S. ; Connor, Linzi ; Zore, Andrej ; Smrkolj, Špela ; Poljak, Mario (avtor, korespondenčni avtor) ; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • 2023 global inventory of commercial molecular tests for human papillomaviruses (HPV); Poljak, Mario (avtor, korespondenčni avtor);Oštrbenk Valenčak, Anja ; Cuschieri, Kate S. ; Bohinc, Klara ; Arbyn, Marc; 2024; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Review of virological methods for laboratory diagnosis and characterization of monkeypox virus (MPXV) : lessons learned from the 2022 Mpox outbreak; Resman Rus, Katarina ;Zakotnik, Samo ; Sagadin, Martin ; Kolenc, Marko ; Skubic, Lucijan ; Knap, Nataša ; Korva, Miša ; Poljak, Mario ; Avšič-Županc, Tatjana (avtor, korespondenčni avtor); 2024; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Herpesviridae and atypical bacteria co-detections in lower respiratory tract samples of SARS-CoV-2-positive patients admitted to an intensive care unit; Grubelnik, Gašper ;Korva, Miša ; Kogoj, Rok ; Polanc, Tina ; Mavrič, Matej ; Jevšnik Virant, Monika ; Uršič, Tina ; Keše, Darja ; Seme, Katja ; Petrovec, Miroslav ; Jereb, Matjaž ; Avšič-Županc, Tatjana (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Exploring Clinical Predictors of Severe Human Metapneumovirus Respiratory Tract Infections in Children: Insights from a Recent Outbreak; Veronese, Airin ; Uršič, Tina (avtor, korespondenčni avtor);Bizjak, Simona ; Rodman, Jasna; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Epidemiological and clinical insights into the enterovirus D68 upsurge in Europe 2021/22 and the emergence of novel B3-derived lineages, ENPEN multicentre study; Pires Simoes, Margarida ; Hodcroft, Emma B ; Simmonds, Peter ; Albert, Jan ; Berginc, Nataša ;Lunar, Maja M. ; Poljak, Mario ; Uršič, Tina; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Biomarkers for prediction of CAR T therapy outcomes : current and future perspectives; Avtorji: Levstek, Lucija ;Janžič, Larisa ; Ihan, Alojz ; Kopitar, Andreja Nataša; 2024; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Elevated levels of serum muscle enzymes in the initial phase of tick-borne encephalitis; Bogovič, Petra (avtor, korespondenčni avtor); Lotrič-Furlan, Stanka ; Ogrinc, Katarina ; Avšič-Županc, Tatjana ;Korva, Miša ; Kastrin, Andrej ; Trampuš-Bakija, Alenka ; Strle, Klemen ; Strle, Franc; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Comparing COVID-19 severity in patients hospitalized for community-associated Delta, BA.1 and BA.4/5 variant infection; Avtorji: Sočan, Maja ; Mrzel, Maja ; Prosenc, Katarina ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Poljak, Mario ; Lunar, Maja M. ; Zupanič, Tina; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Enterovirus D68 circulation between 2014 and 2022 in Slovenian children; Avtorji: Uršič, Tina (korespondenčni avtor);Jevšnik Virant, Monika ; Kogoj, Rok ; Krivec, Uroš ; Prusnik, Joanna ; Mramor, Minca ; Lovšin, Sara ; Petrovec, Miroslav; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Microbiologic findings in a cohort of patients with erythema migrans; Avtorji: Ružić-Sabljić, Eva (avtor, korespondenčni avtor);Maraspin-Čarman, Vera ; Bogovič, Petra ; Rojko, Tereza ; Jaklič, Martina ; Strle, Franc; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Molecular characterization of extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli isolated from lower respiratory tract samples between 2002 and 2019 in the Central Slovenia region; Avtorji: Hrovat, Katja ; Molan, Katja ; Seme, Katja ; Ambrožič, Jerneja; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Parechovirus A circulation and testing capacities in Europe, 2015–2021; Avtorji: Bubba, Laura ; Broberg, Eeva ; Fischer, Thea K ; Simmonds, Peter ; Harvala, Heli ; Berginc, Nataša;Poljak, Mario; Lunar, Maja M. ; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Plectin plays a role in the migration and volume regulation of astrocytes : a potential biomarker of glioblastoma; Avtorji: Žugec, Maja ; Furlani, Borut ; Castañón, Maria J. ; Rituper, Boštjan ; Fischer, Irmgard ; Broggi, Giuseppe ; Caltabiano, Rosario ; Barbagallo, Giuseppe M. V. ; Di Rosa, Michelino ; Tibullo, Daniele ; Simčič, Saša ; Stokin, Gorazd Bernard ; Jorgačevski, Jernej ; Zorec, Robert ; Potokar, Maja (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Poor virus-specific T-cell responses early after tick-borne encephalitis virus infection correlate with disease severity; Avtorji: Aregay, Amare ; Slunečko, Jan ;Bogovič, Petra ; Korva, Miša ; Resman Rus, Katarina ; Knap, Nataša ; Beicht, Jana ; Kubinski, Mareike ; Saletti, Giulietta ; Steffen, Imke ; Strle, Franc ; Avšič-Županc, Tatjana; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Prospective longitudinal study of dynamics of human papillomavirus 6 and 11 infection in anogenital hairs and eyebrows of male patients with anogenital warts and age-matched controls; Avtorji: Tlaker Žunter, Vesna ;Hošnjak, Lea ; Kolenc, Mateja ; Zorec, Tomaž Mark ; Luzar, Boštjan ; Potočnik, Marko ; Miljković, Jovan ; Seme, Katja ; Poljak, Mario (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Seasonality and genotype diversity of human rhinoviruses during an eight-year period in Slovenia; Avtorji: Berginc, Nataša ; Sočan, Maja ; Prosenc, Katarina ; Petrovec, Miroslav; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • The impact of COVID-19 on multidrug-resistant bacteria at a Slovenian tertiary medical center; Avtorji: Mrvič, Tatjana ; Stevanoska, Sintija ; Beović, Bojana ; Logar, Mateja ; Gregorčič, Sergeja ; Žnidaršič, Benica; Seme, Katja ; Velimirović, Ivana ; Švent-Kučina, Nataša ; Maver Vodičar, Polona ; Križan-Hergouth, Veronika ;  Džeroski, Sašo ; Pirš, Mateja; 2024; izvirni znanstveni članek.

   

  2023 – izvirni in pregledni znanstveni članki:

  • • • • • A simplified nasopharyngeal swab collection procedure for minimizing patient discomfort while retaining sample quality; Avtorji: Uršič, Tina ;Kogoj, Rok ; Šikonja, Jaka ;Jevšnik Virant, Monika ; Petrovec, Miroslav; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Alterations in immunophenotype and metabolic profile of mononuclear cells during follow up in children with multisystem inflammatory syndrome (MIS-C); Avtorji: Kopitar, Andreja Nataša ;Repas, Jernej ; Janžič, Larisa ; Bizjak, Maša ; Vesel, Tina ; Emeršič, Nina ; Zajc Avramovič, Mojca ; Ihan, Alojz ; Avčin, Tadej ; Pavlin, Mojca; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Annual (2023) taxonomic update of RNA-directed RNA polymerase-encoding negative-sense RNA viruses (realm Riboviria: kingdom Orthornavirae: phylum Negarnaviricota); Avtorji: Kuhn, Jens H. (avtor, korespondenčni avtor); Abe, Junya ; Adkins, Scott ; Alkhovsky, Sergey V. ; Avšič-Županc, Tatjana ;Ayllón, María A. ; in sodelavci.; 2023; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Assessment of acceptability and determinants of uptake and schedule completion of human papillomavirus (HPV) vaccine by 25 to 45 years old women in Slovenia; Avtorji: Mlakar, Jana ;Oštrbenk Valenčak, Anja ; Kežar, Jožefa ; Beseničar Pregelj, Lara ; Poljak, Mario; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Association between colonization of the respiratory tract with Ureaplasma species and bronchopulmonary dysplasia in newborns with extremely low gestational age : a retrospective study; Avtorji: Gobec, Katja ; Mukenauer, Rebeka ; Keše, Darja ;Erčulj, Vanja ; Grosek, Štefan ; Perme, Tina; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Association of persistent symptoms after lyme neuroborreliosis and Increased levels of interferon-α in blood; Avtorji: Hernández, Sergio A. ; Ogrinc, Katarina ;Korva, Miša ; Kastrin, Andrej ; Bogovič, Petra ; Rojko, Tereza ; Kelley, Keith W. ; Weis, Janis J ; Strle, Franc ; Strle, Klemen; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Atypical skull-base osteomyelitis: comprehensive review and multidisciplinary management viewpoints; Avtorji: Urbančič, Jure ;Vozel, Domen; Battelino, Saba ; Bošnjak, Roman ; Kokošar Ulčar, Barbara ; Matos, Tadeja ; Munda, Matic ; Papst, Lea ; Steiner, Nejc ; Vouk, Matej ; Zidar, Nina; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Case report: Pneumocystis jirovecii pneumonia in a severe case of Aicardi–Goutières syndrome with an IFIH1 gain-of- function mutation mimicking combined immunodeficiency; Avtorji: Železnik, Mojca ;Soltirovska Šalamon, Aneta ; Debeljak, Maruša ; Goropevšek, Aleš ; Šuštar, Nataša ; Ključevšek, Damjana ; Ihan, Alojz ; Avčin, Tadej; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Changes in HRSV epidemiology but not circulating variants in hospitalized children due to the emergence of SARS-CoV-2; Avtorji: Jevšnik Virant, Monika;Luštrek, Manca ; Kogoj, Rok ; Petrovec, Miroslav ; Uršič, Tina; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Characterisation of the Antibody Response in Sinopharm (BBIBP-CorV) recipients and COVID-19 Convalescent Sera from the Republic of Moldova; Avtorji: Ulinici, Mariana ; Suljič, Alen ;Poggianella, Monica ; Bonotto, Rafaela ; Resman Rus, Katarina ; Paraschiv, Angela ; Bonetti, Amedeo Marco ; Todiras, Mihail ; Corlateanu, Alexandru ; Petrovec, Miroslav; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Clinical, laboratory, and radiographic features can help predict Mycoplasma pneumoniae lower respiratory tract infection in children; Avtorji: Rodman, Jasna;Dolenc, Špela ; Krivec, Uroš ; Keše, Darja; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Comparison of 3 enzyme-linked immunoassay methods to evaluate serum concentrations of infliximab and antibodies to infliximab in 32 patients with moderate to severe inflammatory bowel disease; Avtorji: Jukić, Tomislav ;Drobne, David ; Pušavec, Saša ; Ihan, Alojz ; Štubljar, David ; Starc, Andrej; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Dendritic cell activation and cytokine response in vaccine breakthrough TBE patients after in vitro stimulation with TBEV; Avtorji: Marušić, Miša ;Kopitar, Andreja Nataša ; Korva, Miša ; Knap, Nataša ; Bogovič, Petra ; Strle, Franc ; Ihan, Alojz ; Avšič-Županc, Tatjana; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Detection, identification and genotyping of Borrelia spp. in ticks of Coastal-Karst and Littoral-Inner Carniola regions in Slovenia; Avtorji: Šušnjar, Jana ;Cerar Kišek, Tjaša ; Strašek, Katja ; Ružić-Sabljić, Eva ; Kalan, Katja ; Ivović, Vladimir; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Different BD BACTEC™ blood culture bottle types for the detection of fungi in simulated sterile body fluid samples; Avtorji: Tomazin, Rok ;Pliberšek, Tadej ; Oštrbenk Valenčak, Anja ; Matos, Tadeja; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Evaluation of arterial histopathology and microRNA expression that underlie ultrasonography findings in temporal arteries of patients with giant cell arteritis; Avtorji: Suljič, Alen ;Hočevar, Alojzija ; Jurčić, Vesna ; Bolha, Luka; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • FAM19A4/miR124-2 methylation testing and human papillomavirus (HPV) 16/18 genotyping in HPV-positive women under the age of 30 years; Avtorji: Vink, Frederique J. ; Meijer, Chris J.L.M. ; Hesselink, Albertus ; Floore, Arno N. ; Lissenberg-Witte, Birgit I. ; Bonde, Jesper ; Pedersen, Helle ; Cuschieri, Kate S. ; Poljak, Mario ;Oštrbenk Valenčak, Anja; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Fetal death from SARS-CoV-2 mediated acute placental failure; Avtorji: Kosič, Nadja ; Luzar, Boštjan ;Pečlin, Polona ; Druškovič, Mirjam ; Resman Rus, Katarina ; Avšič-Županc, Tatjana ; Premru-Sršen, Tanja; 2023; drugi znanstveni članki.

   

  • • • • • First expert elicitation of knowledge on possible drivers of observed increasing human cases of tick-borne encephalitis in Europe; Avtorji: Saegerman, Claude ; Humblet, Marie-France ; Leandri, Marc ; Gonzalez, Gaëlle ; Heyman, Paul ; Sprong, Hein ; L’Hostis, Monique ; Moutailler, Sara ; Knap, Nataša ;Avšič-Županc, Tatjana; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • High incidence of multisystem inflammatory syndrome and other autoimmune diseases after SARS-CoV-2 infection compared to COVID-19 vaccination in children and adolescents in south central Europe; Avtorji: Bizjak, Maša ; Emeršič, Nina ;Zajc Avramovič, Mojca ; Vesel, Tina ; Mlakar, G. ; Berce, Vojko ; Markelj, Gašper ; Plankar Srovin, Tina ; Golli, Tanja ; Osredkar, Damjan ; Koren, Anja ; Toplak, Nataša ; Pokorn, Marko ; Avšič-Županc, Tatjana ; Ihan, Alojz ; Fafangel, Mario ; Avčin, Tadej; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • HIV-1 subtype B spread through cross-border clusters in the Balkans : a molecular analysis in view of incidence trends; Avtorji: Jovanovic, Luka ; Siljic, Marina ; Cirkovic, Valentina ; Salemovic, Dubravka ; Jevtovic, Djordje ; Alexiev, Ivailo ; Židovec-Lepej, Snježana ; Poljak, Mario ;Lunar, Maja M. ; Stanojevic, Maja; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Impact of the COVID-19 pandemic on community consumption of antibiotics for systemic use and resistance of invasive streptococcus pneumoniae in Slovenia; Avtorji: Kastrin, Tamara ;Mioč, Verica ; Mahnič, Aleksander ; Čižman, Milan ; Velimirović, Ivana; Bombek, Maja; Lugovski, Marica; Ribič, Helena; Grmek-Košnik, Irena; Jeverica, Samo; Juriševič Dodič, Anamarija; Todorović, Aleksandar; Berce, Ingrid; Piltaver-Vajdec, Irena; Lužnik, Dane; Stojoska Surbanovska, Tanja; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Interspecies transmission of porcine-originated G4P[6] rotavirus A between pigs and humans: a synchronized spatiotemporal approach; Avtorji: Kunić, Valentina ; Mikuletič, Tina ;Kogoj, Rok ; Koritnik, Tom ; Steyer, Andrej ; Šoprek, Silvija ; Tešović, Goran ; Konjik, Vlatka ; Roksandić Križan, Ivana ; Prišlin, Marina; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Intrahost monkeypox virus genome variation in patient with early infection, Finland, 2022; Avtorji: Vauhkonen, Hanna ; Kallio-Kokko, Hannimari ; Hiltunen-Back, Eija ; Lönnqvist, Lasse ; Leppäaho-Lakka, Jaana ; Zorec, Tomaž Mark ;Zakotnik, Samo ; Vlaj, Doroteja ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Poljak, Mario; 2023; drugi znanstveni članki.

   

  • • • • • IPVS policy statement on HPV nucleic acid testing guidance for those utilising/considering HPV as primary precancer screening: quality assurance and quality control issues; Avtorji: Garland, Suzanne M. ; Iftner, Thomas ; Cuschieri, Kate S. ; Kaufmann, Andreas M ; Arbyn, Marc ; de Sanjosé, Silvia ; Poljak, Mario ;Dillner, J. ; Unger, Elizabeth R.; 2023; drugi znanstveni članki.

   

  • • • • • Isolation and in vitro characterization of novel S. epidermidis phages for therapeutic applications; Avtorji: Štrancar, Vida ;Marušić, Monika ; Tušar, Jasmina ; Praček, Neža ; Kolenc, Marko ; Šuster, Katja ; Horvat, Simon ; Janež, Nikolaja ; Peterka, Matjaž; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Laboratorijska diagnostika motenj komplementa; Avtorji: Simčič, Saša ;Kouter, Katarina; 2023; samostojni strokovni sestavek ali poglavje v monografski publikaciji.

   

  • • • • • Long-term monitoring of bioaerosols in an environment without UV and desiccation stress, an example from the cave Postojnska Jama, Slovenia; Avtorji: Mulec, Janez ;Skok, Sara ; Tomazin, Rok ; Letić, Jasmina ; Pliberšek, Tadej ; Stopinšek, Sanja ; Simčič, Saša; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Macrophage polarization during Streptococcus agalactiae infection is isolate specific; Avtorji: Janžič, Larisa ;Repas, Jernej ; Pavlin, Mojca ; Zemljič Jokhadar, Špela ; Ihan, Alojz ; Kopitar, Andreja Nataša; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Molecular typing of mastadenoviruses in simultaneously collected nasopharyngeal swabs and stool samples from children hospitalized for acute bronchiolitis, acute gastroenteritis, and febrile seizures; Avtorji: Glinšek Biškup, Urška ;Steyer, Andrej ; Lusa, Lara ; Strle, Franc ; Pokorn, Marko ; Mrvič, Tatjana ; Grosek, Štefan ; Petrovec, Miroslav ; Jevšnik Virant, Monika; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Mycoplasma pneumoniae: gone forever?; Avtorji: Meyer Sauteur, Patrick M. ; Beeton, Michael L ; Keše, Darja; in sod.; 2023; drugi znanstveni članki.

   

  • • • • • Osnove mikrobiologije za študente laboratorijske biomedicine; Avtorji: Glinšek Biškup, Urška (avtor, urednik);Jevšnik Virant, Monika (avtor, urednik); Krošelj, Manca (ilustrator); Petrovec, Miroslav (recenzent); Ružić-Sabljić, Eva (fotograf, recenzent); Pirš, Mateja (fotograf); Šoba, Barbara (fotograf); Sagadin, Martin (fotograf); Kolenc, Marko (fotograf); 2023; univerzitetni učbenik z recenzijo.

   

  • • • • • Postnatal CMV infection and antiviral treatment in extremely premature infants : a 12-year retrospective analysis; Avtorji: Košiček, Rok ; Kristan, Borut ; Erčulj, Vanja ;Kornhauser-Cerar, Lilijana ; Petrovec, Miroslav ; Pokorn, Marko ; Spirovska, Ana ; Uršič, Tina ; Grosek, Štefan ; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • QAC resistance genes in ESBL-producing E. coli isolated from patients with lower respiratory tract infections in the Central Slovenia region—a21-year survey; Avtorji: Hrovat, Katja ;Čremožnik Zupančič, Jerneja ; Seme, Katja ; Ambrožič, Jerneja; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • SARS-CoV-2 vaccination and clinical presentation of COVID-19 in patients hospitalized during the delta- and omicron-predominant periods; Avtorji: Stupica, Daša ;Collinet-Adler, Stefan ; Kejžar, Nataša ; Poljak, Mario ; Štamol, Tina; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • Securing wider EU commitment to the elimination of hepatitis C virus; Avtorji: Wedemeyer, Heiner ; Tergast, Tammo L ; Lazarus, Jeffrey V. ; Razavi, Homie ; Bakoyannis, Kostas ; Baptista-Leite, Ricardo ; Bartoli, Marco ; Bruggmann, Philip ; Busoi, Cristian-Silviu ; Buti, Maria ; Carballo, Manuel ; Matičič, Mojca ;Poljak, Mario; 2023; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Sporadic hepatitis A virus PCR false-positive results observed during reflex testing of serum samples previously tested for Anti-HAV antibodies and caused by contamination with HAV RNA present in the reagents of the commercial Anti-HAV immunoassay; Avtorji: Lunar, Maja M. ;Markočič, Petra ; Fujs Komloš, Kristina ; Štamol, Tina ; Poljak, Mario; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • The association between mycoplasma pneumoniae genotype and cutaneous disease; Avtorji: Rodman, Jasna ;Mrvič, Tatjana ; Košnik, Mitja ; Keše, Darja; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • • • The role of methylation of host and/or human papillomavirus (HPV) DNA in management of cervical intraepithelial neoplasia grade 2 (CIN2) lesions; Avtorji: Dovnik, Andraž ;Poljak, Mario; 2023; pregledni znanstveni članek.

   

  • • • • • Treatment of erythema migrans with doxycycline for 7 days versus 14 days in Slovenia : a randomised open-label non-inferiority trial; Avtorji: Stupica, Daša ;Collinet-Adler, Stefan ; Blagus, Rok ; Gomišček, Anja ; Cerar Kišek, Tjaša ; Ružić-Sabljić, Eva ; Velušček, Maša; 2023; izvirni znanstveni članek.

   

  • • • Unveiling the incidences and trends of the neglected zoonosis cystic echinococcosis in Europe : a systematic review from the MEmE project; Avtorji: Casulli, Adriano ; Abela-Ridder, Bernadette ; Petrone, Daniele ; Fabiani, Maks ; Bobić, Branko ; Carmena, David ; Šoba, Barbara ;Zerem, Enver ; João Gargaté, Maria ; Kuzmanovska, Gordana; in sod.; 2023; pregledni znanstveni članek.