Spremljanje epidemije SARS-CoV-2 v Sloveniji: 01.01.2025 – 21. 01. 2025

V stošestinpetdeseto (156.) presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 60 vzorcev (85% vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 01. 01. 2025 in 21. 01. 2025. Izmed teh je bilo 67 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, 13 % iz Zasavske regije, 8 % iz Gorenjske regije, 7 % iz Jugovzhodne regije in po 2 % iz goriške, Obalno-kraške ter Pomurske regije. Vzorcev oseb s stalnim prebivališčem v tujini ni bilo.

Zaradi stabilne epidemiološke situacije, ECDC od 3. marca 2023 na seznam zaskrbljujočih variant (»Variants of Concern« – VOC) trenutno ne uvršča nobenih linij SARS-CoV-2.

V stošestinpetdesetem presejalnem sekveniranju, ki zajema obdobje od 01. 01. 2025 do 21. 01. 2025, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.

Slika 1. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v obdobju med 01. 01. 2025 in 21. 01. 2025. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu večjem ali enakem 2 %. Srednji in notranji obroč prikazujeta različna nivoja starševskih linij.

Agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji na spletu Od julija 2024 je kot plod sodelovanja Nacionalnega inštituta za javno zdravje (NIJZ), Inštituta za mikrobiologijo in imunologijo (IMI) ter Nacionalnega laboratorija za zdravje, okolje in hrano (NLZOH) na spletu na voljo agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2, kjer se v realnem času zbirajo in osvežujejo podatki laboratorijev, ki izvajamo sekvenciranje. Na voljo je splošni pregled količine sekvenciranih vzorcev, dokazane različice in število VOC, VOI in VUM.

Povezava do spletnega mesta: Spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji