V stotrideseto presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 90 vzorcev (87 % vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 18. 09. 2023 in 01. 10. 2023. Izmed teh je bilo 67 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, 9 % iz Jugovzhodne regije, 7 % iz Zasavske regije, 4 % iz Gorenjske regije, po 2 % iz Goriške, Obalno-kraške, Posavske ter Savinjske regije in 1 % iz Podravske regije. Trije vzorci so pripadali osebam, ki imajo stalno prebivališče v tujini.
Zaradi stabilne epidemiološke situacije, ECDC od 3. marca 2023 na seznam zaskrbljujočih variant (»Variants of Concern« – VOC) trenutno ne uvršča nobenih linij SARS-CoV-2.
V stotridesetem presejalnem obdobju, tedna 38/2023 in 39/2023, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.
Slika 1. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v 38. in 39. tednu 2023. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu ³ 1 %. Notranji obroč prikazuje starševsko linijo. Kategorija RKM predstavlja delež različic nastalih z rekombinacijo.
Slika 2. Delež posameznih podrazličic omikrona potrjenih v celotnem obdobju presejalnega testiranja od pojava B.1.1.529 v Sloveniji dalje.
Nadzor nad potencialno nevarnejšimi različicami (»VOI« / »VUM«)
WHO in ECDC med različice, ki se podrobneje spremljajo (»Variants Of Interest« – VOI; »Variants Under Monitoring« – VUM), trenutno vključujeta BA.2.75, BA.2.86 in rekombinantne različice XBB. Tabela 1 prikazuje število posameznih primerov VOI / VUM, vključujoč podrazličice, dokazanih pri nas.
Tabela 1: Prikaz števila posameznih različic VOI / VUM dokazanih na IMI do vključno 17. 09. 2023.
| Različica† (VOI/VUM) | Teden prve potrditve | Kumulativno število primerov | Dokazana v zadnjem presejalnem obdobju |
| XBB.1.5 (VOI) | 50/2022 | 362 | DA |
| XBB.1.16 (VOI) | 15/2023 | 96 | DA |
| EG.5 (VOI) | 30/2023 | 70 | DA |
| BA.2.75‡ (VUM) | 27/2022 | 25 | DA (DV.7.1) |
| CH.1.1 (VUM) | 46/2022 | 125 | NE |
| XBB‡ (VUM) | 43/2022 | 67 | DA |
| XBB.1.9.1 (VUM) | 04/2023 | 223 | DA |
| XBB.1.9.2 (VUM)‡ | 08/2023 | 115 | DA |
| XBB.2.3 (VUM) | 13/2023 | 39 | DA |
| BA.2.86 (VUM) | 39/2023 | 1 | DA |
| † – vključujoč hčerinske različice, ‡ – brez tistih hčerinskih različic, ki se posebej spremljajo kot VOI / VUM | |||
