V stosedeminpetdeseto (157.) presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 16 vzorcev (52% vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 22. 01. 2025 in 09. 02. 2025. Izmed teh je bilo 38 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, po 13% iz Gorenjske, Goriške ter Podravske regije in po 6% iz Obalno-kraške, Pomurske ter Zasavske regije. En vzorec je pripadal osebi s stalnim prebivališčem v tujini.
Zaradi stabilne epidemiološke situacije, ECDC od 3. marca 2023 na seznam zaskrbljujočih variant (»Variants of Concern« – VOC) trenutno ne uvršča nobenih linij SARS-CoV-2
V stosedeminpetdesetem presejalnem sekveniranju, ki zajema obdobje od 22. 01. 2025 do 09. 02. 2025, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.
Slika 1. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v obdobju med 22. 01. 2025 in 09. 02. 2025. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu večjem ali enakem 2 %. Srednji in notranji obroč prikazujeta različna nivoja starševskih linij.
Agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji na spletu Od julija 2024 je kot plod sodelovanja Nacionalnega inštituta za javno zdravje (NIJZ), Inštituta za mikrobiologijo in imunologijo (IMI) ter Nacionalnega laboratorija za zdravje, okolje in hrano (NLZOH) na spletu na voljo agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2, kjer se v realnem času zbirajo in osvežujejo podatki laboratorijev, ki izvajamo sekvenciranje. Na voljo je splošni pregled količine sekvenciranih vzorcev, dokazane različice in število VOC, VOI in VUM.
Povezava do spletnega mesta: Spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji