V stooseminštirideseto (148.) presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 78 vzorcev (90 % vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 09. 09. 2024 in 18. 09. 2024. Izmed teh je bilo 58 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, 10 % iz Gorenjske regije, 9 % iz Zasavske regije, 4 % iz Jugovzhodne regije, po 3 % iz Goriške, Podravske, Pomurske ter Posavske regije in po 1 % iz Koroške, Obalno-kraške, Primorsko‑notranjske ter Savinjske regije. Trije vzorci so pripadali osebam, ki imajo stalno prebivališče v tujini.
Zaradi stabilne epidemiološke situacije, ECDC od 3. marca 2023 na seznam zaskrbljujočih variant (»Variants of Concern« – VOC) trenutno ne uvršča nobenih linij SARS-CoV-2.
V stooseminštiridesetem presejalnem sekveniranju, ki zajema obdobje od 09. 09. 2024 do 18. 09. 2024, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.
Slika 1. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v obdobju med 09. 09. 2024 in 18. 09. 2024. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu ³ 2 %. Srednji in notranji obroč prikazujeta različna nivoja starševskih linij.
Agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji na spletu
Od julija 2024 je kot plod sodelovanja Nacionalnega inštituta za javno zdravje (NIJZ), Inštituta za mikrobiologijo in imunologijo (IMI) ter Nacionalnega laboratorija za zdravje, okolje in hrano (NLZOH) na spletu na voljo agregirano in avtomatizirano spremljanje različic SARS-CoV-2, kjer se v realnem času zbirajo in osvežujejo podatki laboratorijev, ki izvajamo sekvenciranje. Na voljo je splošni pregled količine sekvenciranih vzorcev, dokazane različice in število VOC, VOI in VUM.
Povezava do spletnega mesta: Spremljanje različic SARS-CoV-2 v Sloveniji