V stošestindvajseto presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 12 vzorcev (92 % vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 24. 07. 2023 in 06. 08. 2023. Izmed teh je bilo 42 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, po 25 % iz Gorenjske ter Obalno-kraške regije in 8 % iz Zasavske regije. Vzorcev oseb s stalnim prebivališčem v tujini ni bilo.
Zaradi stabilne epidemiološke situacije, ECDC od 3. marca 2023 na seznam zaskrbljujočih variant (»Variants of Concern« – VOC) trenutno ne uvršča nobenih linij SARS-CoV-2.
V stošestindvajsetem presejalnem obdobju, tedna 30/2023 in 31/2023, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.
Slika 1. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v 30. in 31. tednu 2023. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu ³ 1 %. Notranji obroč prikazuje starševsko linijo. Kategorija RKM predstavlja delež različic nastalih z rekombinacijo.
Slika 2. Delež posameznih podrazličic omikrona potrjenih v celotnem obdobju presejalnega testiranja od pojava B.1.1.529 v Sloveniji dalje.
Nadzor nad rekombinantnimi različicami XBB
ECDC med različice, ki se podrobneje spremljajo (»Variants of Interest« – VOI), trenutno vključuje tudi različico XBB, ki je nastala z rekombinacijo linij BJ.1 (BA.2.10.1.1) in BM.1.1.1 (BA.2.75.3.1.1.1). Med pod‑različicami XBB se posebej spremljajo XBB.1.5, XBB.1.16 in EG.5 (XBB.1.9.2.5) zaradi hitrega naraščanja primerov.
Tabela 1: Prikaz števila posameznih različic XBB dokazanih na IMI do vključno 06. 08. 2023.
| Različica | Teden prve potrditve | Kumulativno število primerov |
| XBB.1.5 | 50/2022 | 262 |
| XBB.1.5.6 | 10/2023 | 2 |
| XBB.1.5.7 | 07/2023 | 11 |
| XBB.1.5.8 | 14/2023 | 1 |
| XBB.1.5.12 | 15/2023 | 4 |
| XBB.1.5.13 | 13/2023 | 2 |
| XBB.1.5.14 | 13/2023 | 1 |
| EL.1 (XBB 1.5.14.1) | 26/2023 | 4 |
| XBB.1.5.17 | 14/2023 | 3 |
| XBB.1.5.24 | 16/2023 | 1 |
| EU.1.1 (XBB.1.5.26.1.1) | 15/2023 | 21 |
| EU.1.1.1 (XBB.1.5.26.1.1.1) | 22/2023 | 4 |
| XBB.1.5.28 | 16/2023 | 1 |
| XBB.1.5.37 | 13/2023 | 11 |
| XBB.1.5.38 | 13/2023 | 15 |
| XBB.1.5.59 | 28/2023 | 1 |
| GK.1 (XBB.1.5.70.1) | 29/2023 | 1 |
| XBB.1.5.71 | 28/2023 | 1 |
| XBB.2† | 45/2022 | 14 |
| XBB.1‡ | 43/2022 | 331 |
| XBB.1.16 | 15/2023 | 46 |
| XBB.1.16.1 | 17/2023 | 2 |
| XBB.1.16.3 | 24/2023 | 1 |
| XBB.1.16.6 | 28/2023 | 1 |
| XBB.1.16.11 | 31/2023 | 1 |
| EG.5.1 (XBB.1.9.2.5.1) | 30/2023 | 3 |
| † vključno s hčerinskimi linijami razen XBB.1.16 in EG.5; ‡ vključno s hčerinskimi linijami razen XBB.1.5. | ||
