Katalog preiskav
Bakterijski širokospektralni PCR (EU PCR)
Področje preiskave
BAKTERIOLOGIJA IN MIKOLOGIJA
Opis preiskave
Molekularni dokaz in identifikacija bakterij v primarno sterilnih kužninah. Dokaz gena za 16S rRNA in določanje nukleotidnega zaporedja le-tega.
Preiskava je primerna za kužnine iz primarno sterilnih mest. Preiskavo priporočamo ob negativni kultivaciji ali v primeru že predhodno uvedene antibiotične terapije. V primeru majhega števila bakterij v vzorcu, je rezultat lahko negativen.
Splošni podatki
Sprejem vzorcev
Od ponedeljka do sobote, 07:00 - 18:00; nedelje in prazniki 8:00 - 16:00
Urnik izvajanja preiskave
Od ponedeljka do petka, 07:00 - 15:00, sobota 7:00 - 10:00
Trajanje preiskave
1-3 dni
Metode preiskave
PCR, sekvenciranje, analiza sekvenc
Vzorci in navodila
Absces; punktat
Navodila za odvzem:
Površinski eksudat odstranimo s sterilno fiziološko raztopino, gnoj aspiriramo ali punktiramo iz dna in iz stene abscesa. Pred odvzemom punktata površino kože kirurško očistimo z antiseptikom. STROGO aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Absces; vsebina
Navodila za odvzem:
Površinski eksudat odstranimo s sterilno fiziološko raztopino, gnoj aspiriramo ali punktiramo iz dna in iz stene abscesa. Pred odvzemom punktata površino kože kirurško očistimo z antiseptikom. STROGO aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna posodica z navojem.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Ascites; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; odvzamemo s punkcijo perkutano ali s kirurškim posegom. STROGO aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Bezgavka; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; odvzamemo s punkcijo perkutano ali s kirurškim posegom. STROGO aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Bronh; izpirek
Navodila za odvzem:
Bronhoskopsko spiranje predela pljuč; izvede izkušen bronhoskopist po veljavnih standardnih postopkih. STROGO aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna posodica z navojem.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Bronhoalveolarni izpirek (BAL) - mini
Navodila za odvzem:
Bronhoskopsko spiranje predela pljuč; izvede izkušen bronhoskopist po veljavnih standardnih postopkih. STROGO aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna posodica z navojem.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Bronhoalveolarni izpirek (BAL)
Navodila za odvzem:
Bronhoskopsko spiranje predela pljuč; izvede izkušen bronhoskopist po veljavnih standardnih postopkih. STROGO aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna posodica z navojem.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Cista; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; odvzamemo s punkcijo perkutano ali s kirurškim posegom. Majhnim vzorcem dodamo nekaj kapljic sterilne fiziološke raztopine. STROGO aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Kost
Navodila za odvzem:
S kirurškim posegom odvzamemo košček tkiva, damo v sterilno posodico; majhnim vzorcem dodamo nekaj kapljic sterilne fiziološke raztopine. STROGO aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna posodica z navojem.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Kri - venska z EDTA
Navodila za odvzem:
Strogo aseptični odvzem iz periferne vene ob pravem času po navodilih za odvzem hemokulture.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C.
Količina:
Vakumska epruveta z dodanim antikoagulantom EDTA.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Likvor
Navodila za odvzem:
Strogo aseptično odvzamemo s punkcijo (zdravnik) iz hrbteničnega kanala; predtem kožo razkužimo z ustreznim razkužilom; če je odvzem iz ventrikularne drenaže, označimo na Spremnem listu.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C, več kot 24 ur pri -20°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Perikardialna tekočina; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; odvzamemo s punkcijo perkutano ali s kirurškim posegom. Strogo aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Plevralna tekočina; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; odvzamemo s punkcijo perkutano ali s kirurškim posegom. Strogo aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Prekatna vodka
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Rana - opeklinska; punktat
Navodila za odvzem:
Površinski eksudat odstranimo s sterilno fiziološko raztopino. Kužnino s punkcijo odvzamemo z napredujočega roba rane.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Rana - operacijska; punktat
Navodila za odvzem:
Površinski eksudat odstranimo s sterilno fiziološko raztopino. Kužnino s punkcijo odvzamemo z napredujočega roba rane.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Rana - neopredeljena; punktat
Navodila za odvzem:
Površinski eksudat odstranimo s sterilno fiziološko raztopino. Kužnino s punkcijo odvzamemo z napredujočega roba rane.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem.damo v sterilno epruveto z navojem ali stekleničko s transportnim gojiščem za anaerobe ≥2 ml.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Sklep - kolčni; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; strogo aseptično odvzamemo s punkcijo perkutano.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Sklep - kolenski; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; strogo aseptično odvzamemo s punkcijo perkutano.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Sklep - komolčni; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; strogo aseptično odvzamemo s punkcijo perkutano.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Sklep - ramenski; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; strogo aseptično odvzamemo s punkcijo perkutano.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Sklep - skočni; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; strogo aseptično odvzamemo s punkcijo perkutano.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Sklep - zapestni; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; strogo aseptično odvzamemo s punkcijo perkutano.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Sklep - neopredeljen; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; strogo aseptično odvzamemo s punkcijo perkutano.
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem ali pustimo v injekcijski brizgi v primeru, če je kužnine malo.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Steklovina
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Tkivo; biopt
Navodila za odvzem:
S kirurškim posegom odvzamemo košček tkiva, damo v sterilno posodico; majhnim vzorcem dodamo nekaj kapljic sterilne fiziološke raztopine. STROGO aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna posodica z navojem.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt:
Tkivo; punktat
Navodila za odvzem:
Ustrezno razkužimo odvzemno mesto; odvzamemo s punkcijo perkutano ali s kirurškim posegom. Majhnim vzorcem dodamo nekaj kapljic sterilne fiziološke raztopine. STROGO aseptični odvzem!
Navodila za transport:
Optimalni transport ≤2 uri pri 4°C, daljši transport ≤24 ur pri 4°C. Če je isti vzorec tudi za kultivacijo, obvezno transport po navodilih za kultivacijo.
Količina:
Sterilna epruveta z navojem.
Izvajalec preiskave:
Laboratorij za sindromsko diagnostiko in molekularno bakteriologijo (SMB)
Kontakt: