V stosedmo presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 60 vzorcev (71 % vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 16. 01. 2023 in 22. 01. 2023. Izmed teh je bilo 68 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, po 8 % iz Gorenjske in Jugovzhodne regije, po 3 % iz Obalno-kraške, Savinjske in Zasavske regije ter po 2 % iz Goriške, Podravske in Posavske regije. Vzorcev oseb s stalnim prebivališčem v tujini ni bilo.
ECDC od 11. avgusta 2022 na seznam zaskrbljujočih variant uvršča 3 različice omikrona (BA.2, BA.4 in BA.5) ter njihove hčerinske linije. V stosedmem presejalnem obdobju, teden 3/2023, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.
Slika 2. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v 3. tednu 2023. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu > 1 %. Notranji obroč prikazuje starševsko linijo. Kategorija RKM predstavlja delež različic nastalih z rekombinacijo.
Slika 3. Delež posameznih podrazličic omikrona potrjenih v celotnem obdobju presejalnega testiranja od pojava B.1.1.529 v Sloveniji dalje.
Nadzor nad rekombinantnimi različicami XBB
ECDC od 8. decembra 2022 med različice, ki se podrobneje spremljajo (»Variants of Interest« – VOI) vključuje tudi različico XBB, ki je nastala z rekombinacijo linij BJ.1 (BA.2.10.1.1) in BM.1.1.1 (BA.2.75.3.1.1.1). Med pod-različicami XBB se posebej spremlja XBB.1.5 zaradi hitrega naraščanja primerov.
Tabela 1: Prikaz števila posameznih različic XBB dokazanih na IMI do vključno 22.01.2023.
| Različica | Teden prve potrditve | Kumulativno število primerov |
| XBB.1.5 | 50/2022 | 39 |
| XBB.2 | 45/2022 | 4 |
| XBB.1 | 43/2022 | 30 |
