V stoosmo presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 37 vzorcev (74 % vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 23. 01. 2023 in 29. 01. 2023. Izmed teh je bilo 70 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, 14 % iz Obalno-kraške regije, 8 % iz Jugovzhodne regije, 5 % iz Gorenjske regije in 3 % iz Savinjske regije. Vzorcev oseb s stalnim prebivališčem v tujini ni bilo.
ECDC od 11. avgusta 2022 na seznam zaskrbljujočih variant uvršča 3 različice omikrona (BA.2, BA.4 in BA.5) ter njihove hčerinske linije. V stoosmem presejalnem obdobju, teden 4/2023, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.
Slika 2. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v 4. tednu 2023. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu > 1 %. Notranji obroč prikazuje starševsko linijo. Kategorija RKM predstavlja delež različic nastalih z rekombinacijo.
Slika 3. Delež posameznih podrazličic omikrona potrjenih v celotnem obdobju presejalnega testiranja od pojava B.1.1.529 v Sloveniji dalje.
Nadzor nad rekombinantnimi različicami XBB
ECDC od 8. decembra 2022 med različice, ki se podrobneje spremljajo (»Variants of Interest« – VOI) vključuje tudi različico XBB, ki je nastala z rekombinacijo linij BJ.1 (BA.2.10.1.1) in BM.1.1.1 (BA.2.75.3.1.1.1). Med pod-različicami XBB se posebej spremlja XBB.1.5 zaradi hitrega naraščanja primerov.
Tabela 1: Prikaz števila posameznih različic XBB dokazanih na IMI do vključno 29.01.2023.
| Različica | Teden prve potrditve | Kumulativno število primerov |
| XBB.1.5 | 50/2022 | 42 |
| XBB.2† | 45/2022 | 4 |
| XBB.1‡ | 43/2022 | 31 |
| † vključno s hčerinskimi linijami; ‡ vključno s hčerinskimi linijami razen XBB.1.5. | ||
