Raziskovalna dejavnost

Raziskovalne objave

(Posodobljeno: 04.04.2024)

VEČ OBJAV

2024 – izvirni in pregledni znanstveni članki:

• Biomarkers for prediction of CAR T therapy outcomes : current and future perspectives; Avtorji: Levstek, Lucija ;Janžič, Larisa ; Ihan, Alojz ; Kopitar, Andreja Nataša; 2024; pregledni znanstveni članek.

 

• Comparing COVID-19 severity in patients hospitalized for community-associated Delta, BA.1 and BA.4/5 variant infection; Avtorji: Sočan, Maja ; Mrzel, Maja ; Prosenc, Katarina ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Poljak, Mario ; Lunar, Maja M. ; Zupanič, Tina; 2024; izvirni znanstveni članek.

 

• Enterovirus D68 circulation between 2014 and 2022 in Slovenian children; Avtorji: Uršič, Tina (korespondenčni avtor);Jevšnik Virant, Monika ; Kogoj, Rok ; Krivec, Uroš ; Prusnik, Joanna ; Mramor, Minca ; Lovšin, Sara ; Petrovec, Miroslav; 2024; izvirni znanstveni članek.

 

• Microbiologic findings in a cohort of patients with erythema migrans; Avtorji: Ružić-Sabljić, Eva (avtor, korespondenčni avtor);Maraspin-Čarman, Vera ; Bogovič, Petra ; Rojko, Tereza ; Jaklič, Martina ; Strle, Franc; 2024; izvirni znanstveni članek.

 

• Molecular characterization of extended-spectrum β-lactamase-producing Escherichia coli isolated from lower respiratory tract samples between 2002 and 2019 in the Central Slovenia region; Avtorji: Hrovat, Katja ; Molan, Katja ; Seme, Katja ; Ambrožič, Jerneja; 2024; izvirni znanstveni članek.

 

• Parechovirus A circulation and testing capacities in Europe, 2015–2021; Avtorji: Bubba, Laura ; Broberg, Eeva ; Fischer, Thea K ; Simmonds, Peter ; Harvala, Heli ; Berginc, Nataša;Poljak, Mario; Lunar, Maja M. ; 2024; izvirni znanstveni članek.

 

• Plectin plays a role in the migration and volume regulation of astrocytes : a potential biomarker of glioblastoma; Avtorji: Žugec, Maja ; Furlani, Borut ; Castañón, Maria J. ; Rituper, Boštjan ; Fischer, Irmgard ; Broggi, Giuseppe ; Caltabiano, Rosario ; Barbagallo, Giuseppe M. V. ; Di Rosa, Michelino ; Tibullo, Daniele ; Simčič, Saša ; Stokin, Gorazd Bernard ; Jorgačevski, Jernej ; Zorec, Robert ; Potokar, Maja (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

 

• Poor virus-specific T-cell responses early after tick-borne encephalitis virus infection correlate with disease severity; Avtorji: Aregay, Amare ; Slunečko, Jan ;Bogovič, Petra ; Korva, Miša ; Resman Rus, Katarina ; Knap, Nataša ; Beicht, Jana ; Kubinski, Mareike ; Saletti, Giulietta ; Steffen, Imke ; Strle, Franc ; Avšič-Županc, Tatjana; 2024; izvirni znanstveni članek.

 

• Prospective longitudinal study of dynamics of human papillomavirus 6 and 11 infection in anogenital hairs and eyebrows of male patients with anogenital warts and age-matched controls; Avtorji: Tlaker Žunter, Vesna ;Hošnjak, Lea ; Kolenc, Mateja ; Zorec, Tomaž Mark ; Luzar, Boštjan ; Potočnik, Marko ; Miljković, Jovan ; Seme, Katja ; Poljak, Mario (avtor, korespondenčni avtor); 2024; izvirni znanstveni članek.

 

• Seasonality and genotype diversity of human rhinoviruses during an eight-year period in Slovenia; Avtorji: Berginc, Nataša ; Sočan, Maja ; Prosenc, Katarina ; Petrovec, Miroslav; 2024; izvirni znanstveni članek.

 

• The impact of COVID-19 on multidrug-resistant bacteria at a Slovenian tertiary medical center; Avtorji: Mrvič, Tatjana ; Stevanoska, Sintija ; Beović, Bojana ; Logar, Mateja ; Gregorčič, Sergeja ; Žnidaršič, Benica; Seme, Katja ; Velimirović, Ivana ; Švent-Kučina, Nataša ; Maver Vodičar, Polona ; Križan-Hergouth, Veronika ;  Džeroski, Sašo ; Pirš, Mateja; 2024; izvirni znanstveni članek.

 

2023 – izvirni in pregledni znanstveni članki:

• A simplified nasopharyngeal swab collection procedure for minimizing patient discomfort while retaining sample quality; Avtorji: Uršič, Tina ;Kogoj, Rok ; Šikonja, Jaka ;Jevšnik Virant, Monika ; Petrovec, Miroslav; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Alterations in immunophenotype and metabolic profile of mononuclear cells during follow up in children with multisystem inflammatory syndrome (MIS-C); Avtorji: Kopitar, Andreja Nataša ;Repas, Jernej ; Janžič, Larisa ; Bizjak, Maša ; Vesel, Tina ; Emeršič, Nina ; Zajc Avramovič, Mojca ; Ihan, Alojz ; Avčin, Tadej ; Pavlin, Mojca; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Annual (2023) taxonomic update of RNA-directed RNA polymerase-encoding negative-sense RNA viruses (realm Riboviria: kingdom Orthornavirae: phylum Negarnaviricota); Avtorji: Kuhn, Jens H. (avtor, korespondenčni avtor); Abe, Junya ; Adkins, Scott ; Alkhovsky, Sergey V. ; Avšič-Županc, Tatjana ;Ayllón, María A. ; in sodelavci.; 2023; pregledni znanstveni članek.

 

• Assessment of acceptability and determinants of uptake and schedule completion of human papillomavirus (HPV) vaccine by 25 to 45 years old women in Slovenia; Avtorji: Mlakar, Jana ;Oštrbenk Valenčak, Anja ; Kežar, Jožefa ; Beseničar Pregelj, Lara ; Poljak, Mario; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Association between colonization of the respiratory tract with Ureaplasma species and bronchopulmonary dysplasia in newborns with extremely low gestational age : a retrospective study; Avtorji: Gobec, Katja ; Mukenauer, Rebeka ; Keše, Darja ;Erčulj, Vanja ; Grosek, Štefan ; Perme, Tina; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Association of persistent symptoms after lyme neuroborreliosis and Increased levels of interferon-α in blood; Avtorji: Hernández, Sergio A. ; Ogrinc, Katarina ;Korva, Miša ; Kastrin, Andrej ; Bogovič, Petra ; Rojko, Tereza ; Kelley, Keith W. ; Weis, Janis J ; Strle, Franc ; Strle, Klemen; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Atypical skull-base osteomyelitis: comprehensive review and multidisciplinary management viewpoints; Avtorji: Urbančič, Jure ;Vozel, Domen; Battelino, Saba ; Bošnjak, Roman ; Kokošar Ulčar, Barbara ; Matos, Tadeja ; Munda, Matic ; Papst, Lea ; Steiner, Nejc ; Vouk, Matej ; Zidar, Nina; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Case report: Pneumocystis jirovecii pneumonia in a severe case of Aicardi–Goutières syndrome with an IFIH1 gain-of- function mutation mimicking combined immunodeficiency; Avtorji: Železnik, Mojca ;Soltirovska Šalamon, Aneta ; Debeljak, Maruša ; Goropevšek, Aleš ; Šuštar, Nataša ; Ključevšek, Damjana ; Ihan, Alojz ; Avčin, Tadej; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Changes in HRSV epidemiology but not circulating variants in hospitalized children due to the emergence of SARS-CoV-2; Avtorji: Jevšnik Virant, Monika;Luštrek, Manca ; Kogoj, Rok ; Petrovec, Miroslav ; Uršič, Tina; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Characterisation of the Antibody Response in Sinopharm (BBIBP-CorV) recipients and COVID-19 Convalescent Sera from the Republic of Moldova; Avtorji: Ulinici, Mariana ; Suljič, Alen ;Poggianella, Monica ; Bonotto, Rafaela ; Resman Rus, Katarina ; Paraschiv, Angela ; Bonetti, Amedeo Marco ; Todiras, Mihail ; Corlateanu, Alexandru ; Petrovec, Miroslav; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Clinical, laboratory, and radiographic features can help predict Mycoplasma pneumoniae lower respiratory tract infection in children; Avtorji: Rodman, Jasna;Dolenc, Špela ; Krivec, Uroš ; Keše, Darja; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Comparison of 3 enzyme-linked immunoassay methods to evaluate serum concentrations of infliximab and antibodies to infliximab in 32 patients with moderate to severe inflammatory bowel disease; Avtorji: Jukić, Tomislav ;Drobne, David ; Pušavec, Saša ; Ihan, Alojz ; Štubljar, David ; Starc, Andrej; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Dendritic cell activation and cytokine response in vaccine breakthrough TBE patients after in vitro stimulation with TBEV; Avtorji: Marušić, Miša ;Kopitar, Andreja Nataša ; Korva, Miša ; Knap, Nataša ; Bogovič, Petra ; Strle, Franc ; Ihan, Alojz ; Avšič-Županc, Tatjana; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Detection, identification and genotyping of Borrelia spp. in ticks of Coastal-Karst and Littoral-Inner Carniola regions in Slovenia; Avtorji: Šušnjar, Jana ;Cerar Kišek, Tjaša ; Strašek, Katja ; Ružić-Sabljić, Eva ; Kalan, Katja ; Ivović, Vladimir; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Different BD BACTEC™ blood culture bottle types for the detection of fungi in simulated sterile body fluid samples; Avtorji: Tomazin, Rok ;Pliberšek, Tadej ; Oštrbenk Valenčak, Anja ; Matos, Tadeja; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Evaluation of arterial histopathology and microRNA expression that underlie ultrasonography findings in temporal arteries of patients with giant cell arteritis; Avtorji: Suljič, Alen ;Hočevar, Alojzija ; Jurčić, Vesna ; Bolha, Luka; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• FAM19A4/miR124-2 methylation testing and human papillomavirus (HPV) 16/18 genotyping in HPV-positive women under the age of 30 years; Avtorji: Vink, Frederique J. ; Meijer, Chris J.L.M. ; Hesselink, Albertus ; Floore, Arno N. ; Lissenberg-Witte, Birgit I. ; Bonde, Jesper ; Pedersen, Helle ; Cuschieri, Kate S. ; Poljak, Mario ;Oštrbenk Valenčak, Anja; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Fetal death from SARS-CoV-2 mediated acute placental failure; Avtorji: Kosič, Nadja ; Luzar, Boštjan ;Pečlin, Polona ; Druškovič, Mirjam ; Resman Rus, Katarina ; Avšič-Županc, Tatjana ; Premru-Sršen, Tanja; 2023; drugi znanstveni članki.

 

• First expert elicitation of knowledge on possible drivers of observed increasing human cases of tick-borne encephalitis in Europe; Avtorji: Saegerman, Claude ; Humblet, Marie-France ; Leandri, Marc ; Gonzalez, Gaëlle ; Heyman, Paul ; Sprong, Hein ; L’Hostis, Monique ; Moutailler, Sara ; Knap, Nataša ;Avšič-Županc, Tatjana; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• High incidence of multisystem inflammatory syndrome and other autoimmune diseases after SARS-CoV-2 infection compared to COVID-19 vaccination in children and adolescents in south central Europe; Avtorji: Bizjak, Maša ; Emeršič, Nina ;Zajc Avramovič, Mojca ; Vesel, Tina ; Mlakar, G. ; Berce, Vojko ; Markelj, Gašper ; Plankar Srovin, Tina ; Golli, Tanja ; Osredkar, Damjan ; Koren, Anja ; Toplak, Nataša ; Pokorn, Marko ; Avšič-Županc, Tatjana ; Ihan, Alojz ; Fafangel, Mario ; Avčin, Tadej; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• HIV-1 subtype B spread through cross-border clusters in the Balkans : a molecular analysis in view of incidence trends; Avtorji: Jovanovic, Luka ; Siljic, Marina ; Cirkovic, Valentina ; Salemovic, Dubravka ; Jevtovic, Djordje ; Alexiev, Ivailo ; Židovec-Lepej, Snježana ; Poljak, Mario ;Lunar, Maja M. ; Stanojevic, Maja; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Impact of the COVID-19 pandemic on community consumption of antibiotics for systemic use and resistance of invasive streptococcus pneumoniae in Slovenia; Avtorji: Kastrin, Tamara ;Mioč, Verica ; Mahnič, Aleksander ; Čižman, Milan ; Velimirović, Ivana; Bombek, Maja; Lugovski, Marica; Ribič, Helena; Grmek-Košnik, Irena; Jeverica, Samo; Juriševič Dodič, Anamarija; Todorović, Aleksandar; Berce, Ingrid; Piltaver-Vajdec, Irena; Lužnik, Dane; Stojoska Surbanovska, Tanja; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Interspecies transmission of porcine-originated G4P[6] rotavirus A between pigs and humans: a synchronized spatiotemporal approach; Avtorji: Kunić, Valentina ; Mikuletič, Tina ;Kogoj, Rok ; Koritnik, Tom ; Steyer, Andrej ; Šoprek, Silvija ; Tešović, Goran ; Konjik, Vlatka ; Roksandić Križan, Ivana ; Prišlin, Marina; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Intrahost monkeypox virus genome variation in patient with early infection, Finland, 2022; Avtorji: Vauhkonen, Hanna ; Kallio-Kokko, Hannimari ; Hiltunen-Back, Eija ; Lönnqvist, Lasse ; Leppäaho-Lakka, Jaana ; Zorec, Tomaž Mark ;Zakotnik, Samo ; Vlaj, Doroteja ; Korva, Miša ; Avšič-Županc, Tatjana ; Poljak, Mario; 2023; drugi znanstveni članki.

 

• IPVS policy statement on HPV nucleic acid testing guidance for those utilising/considering HPV as primary precancer screening: quality assurance and quality control issues; Avtorji: Garland, Suzanne M. ; Iftner, Thomas ; Cuschieri, Kate S. ; Kaufmann, Andreas M ; Arbyn, Marc ; de Sanjosé, Silvia ; Poljak, Mario ;Dillner, J. ; Unger, Elizabeth R.; 2023; drugi znanstveni članki.

 

• Isolation and in vitro characterization of novel S. epidermidis phages for therapeutic applications; Avtorji: Štrancar, Vida ;Marušić, Monika ; Tušar, Jasmina ; Praček, Neža ; Kolenc, Marko ; Šuster, Katja ; Horvat, Simon ; Janež, Nikolaja ; Peterka, Matjaž; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Laboratorijska diagnostika motenj komplementa; Avtorji: Simčič, Saša ;Kouter, Katarina; 2023; samostojni strokovni sestavek ali poglavje v monografski publikaciji.

 

• Long-term monitoring of bioaerosols in an environment without UV and desiccation stress, an example from the cave Postojnska Jama, Slovenia; Avtorji: Mulec, Janez ;Skok, Sara ; Tomazin, Rok ; Letić, Jasmina ; Pliberšek, Tadej ; Stopinšek, Sanja ; Simčič, Saša; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Macrophage polarization during Streptococcus agalactiae infection is isolate specific; Avtorji: Janžič, Larisa ;Repas, Jernej ; Pavlin, Mojca ; Zemljič Jokhadar, Špela ; Ihan, Alojz ; Kopitar, Andreja Nataša; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Molecular typing of mastadenoviruses in simultaneously collected nasopharyngeal swabs and stool samples from children hospitalized for acute bronchiolitis, acute gastroenteritis, and febrile seizures; Avtorji: Glinšek Biškup, Urška ;Steyer, Andrej ; Lusa, Lara ; Strle, Franc ; Pokorn, Marko ; Mrvič, Tatjana ; Grosek, Štefan ; Petrovec, Miroslav ; Jevšnik Virant, Monika; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Mycoplasma pneumoniae: gone forever?; Avtorji: Meyer Sauteur, Patrick M. ; Beeton, Michael L ; Keše, Darja; in sod.; 2023; drugi znanstveni članki.

 

• Osnove mikrobiologije za študente laboratorijske biomedicine; Avtorji: Glinšek Biškup, Urška (avtor, urednik);Jevšnik Virant, Monika (avtor, urednik); Krošelj, Manca (ilustrator); Petrovec, Miroslav (recenzent); Ružić-Sabljić, Eva (fotograf, recenzent); Pirš, Mateja (fotograf); Šoba, Barbara (fotograf); Sagadin, Martin (fotograf); Kolenc, Marko (fotograf); 2023; univerzitetni učbenik z recenzijo.

 

• Postnatal CMV infection and antiviral treatment in extremely premature infants : a 12-year retrospective analysis; Avtorji: Košiček, Rok ; Kristan, Borut ; Erčulj, Vanja ;Kornhauser-Cerar, Lilijana ; Petrovec, Miroslav ; Pokorn, Marko ; Spirovska, Ana ; Uršič, Tina ; Grosek, Štefan ; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• QAC resistance genes in ESBL-producing E. coli isolated from patients with lower respiratory tract infections in the Central Slovenia region—a21-year survey; Avtorji: Hrovat, Katja ;Čremožnik Zupančič, Jerneja ; Seme, Katja ; Ambrožič, Jerneja; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• SARS-CoV-2 vaccination and clinical presentation of COVID-19 in patients hospitalized during the delta- and omicron-predominant periods; Avtorji: Stupica, Daša ;Collinet-Adler, Stefan ; Kejžar, Nataša ; Poljak, Mario ; Štamol, Tina; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Securing wider EU commitment to the elimination of hepatitis C virus; Avtorji: Wedemeyer, Heiner ; Tergast, Tammo L ; Lazarus, Jeffrey V. ; Razavi, Homie ; Bakoyannis, Kostas ; Baptista-Leite, Ricardo ; Bartoli, Marco ; Bruggmann, Philip ; Busoi, Cristian-Silviu ; Buti, Maria ; Carballo, Manuel ; Matičič, Mojca ;Poljak, Mario; 2023; pregledni znanstveni članek.

 

• Sporadic hepatitis A virus PCR false-positive results observed during reflex testing of serum samples previously tested for Anti-HAV antibodies and caused by contamination with HAV RNA present in the reagents of the commercial Anti-HAV immunoassay; Avtorji: Lunar, Maja M. ;Markočič, Petra ; Fujs Komloš, Kristina ; Štamol, Tina ; Poljak, Mario; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• The association between mycoplasma pneumoniae genotype and cutaneous disease; Avtorji: Rodman, Jasna ;Mrvič, Tatjana ; Košnik, Mitja ; Keše, Darja; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• The role of methylation of host and/or human papillomavirus (HPV) DNA in management of cervical intraepithelial neoplasia grade 2 (CIN2) lesions; Avtorji: Dovnik, Andraž ;Poljak, Mario; 2023; pregledni znanstveni članek.

 

• Treatment of erythema migrans with doxycycline for 7 days versus 14 days in Slovenia : a randomised open-label non-inferiority trial; Avtorji: Stupica, Daša ;Collinet-Adler, Stefan ; Blagus, Rok ; Gomišček, Anja ; Cerar Kišek, Tjaša ; Ružić-Sabljić, Eva ; Velušček, Maša; 2023; izvirni znanstveni članek.

 

• Unveiling the incidences and trends of the neglected zoonosis cystic echinococcosis in Europe : a systematic review from the MEmE project; Avtorji: Casulli, Adriano ; Abela-Ridder, Bernadette ; Petrone, Daniele ; Fabiani, Maks ; Bobić, Branko ; Carmena, David ; Šoba, Barbara ;Zerem, Enver ; João Gargaté, Maria ; Kuzmanovska, Gordana; in sod.; 2023; pregledni znanstveni članek.