V stoenajsto presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 58 vzorcev (84 % vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 13. 02. 2023 in 19. 02. 2023. Izmed teh je bilo 55 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, 9 % iz Zasavske regije, 7 % iz Gorenjske regije, po 5 % iz Jugovzhodne ter Obalno-kraške regije, po 3 % Goriške, Pomurske, Posavske ter Savinjske regije in po 2 % iz Podravske ter Primorsko-notranjske regije. En vzorec je pripadal osebi, ki ima stalno prebivališče v tujini.
ECDC od 11. avgusta 2022 na seznam zaskrbljujočih variant uvršča 3 različice omikrona (BA.2, BA.4 in BA.5) ter njihove hčerinske linije. V stoenajstem presejalnem obdobju, teden 7/2023, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.
Slika 1. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v 7. tednu 2023. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu > 1 %. Notranji obroč prikazuje starševsko linijo. Kategorija RKM predstavlja delež različic nastalih z rekombinacijo.
Slika 2. Delež posameznih podrazličic omikrona potrjenih v celotnem obdobju presejalnega testiranja od pojava B.1.1.529 v Sloveniji dalje.
Nadzor nad rekombinantnimi različicami XBB
ECDC od 8. decembra 2022 med različice, ki se podrobneje spremljajo (»Variants of Interest« – VOI) vključuje tudi različico XBB, ki je nastala z rekombinacijo linij BJ.1 (BA.2.10.1.1) in BM.1.1.1 (BA.2.75.3.1.1.1). Med pod-različicami XBB se posebej spremlja XBB.1.5 zaradi hitrega naraščanja primerov.
Tabela 1: Prikaz števila posameznih različic XBB dokazanih na IMI do vključno 19.02.2023.
| Različica | Teden prve potrditve | Kumulativno število primerov | ||
| XBB.1.5 | 50/2022 | 63 | ||
| XBB.1.5.7 | 07/2023 | 2 | ||
| XBB.2† | 45/2022 | 4 | ||
| XBB.1‡ | 43/2022 | 39 | ||
| † vključno s hčerinskimi linijami; ‡ vključno s hčerinskimi linijami razen XBB.1.5. | ||||
