V stotriintrideseto presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 237 vzorcev (89 % vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 23. 10. 2023 in 12. 11. 2023. Izmed teh je bilo 64 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, 8 % iz Zasavske regije, 7 % iz Jugovzhodne regije, 5 % iz Gorenjske regije, 4 % iz Obalno-kraške regije, 3 % iz Podravske regije, po 2 % iz Koroške ter Savinjske regije in po 1 % iz Goriške, Pomurske ter Primorsko-notranjske regije. Šest vzorcev je pripadalo osebam, ki imajo stalno prebivališče v tujini.
Zaradi stabilne epidemiološke situacije, ECDC od 3. marca 2023 na seznam zaskrbljujočih variant (»Variants of Concern« – VOC) trenutno ne uvršča nobenih linij SARS-CoV-2.
V stotriintridesetem presejalnem obdobju, tedni 43/2023, 44/2023 in 45/2023, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.
Slika 1. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v 43., 44. in 45. tednu 2023. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu ³ 1 %. Srednji in notranji obroč prikazujeta različna nivoja starševskih linij. Kategorija RKM predstavlja delež različic nastalih z rekombinacijo.
Slika 2. Delež posameznih podrazličic omikrona potrjenih v celotnem obdobju presejalnega testiranja od pojava B.1.1.529 v Sloveniji dalje.
Nadzor nad potencialno nevarnejšimi različicami (»VOI« / »VUM«)
WHO in ECDC med različice, ki se podrobneje spremljajo (»Variants Of Interest« – VOI; »Variants Under Monitoring« – VUM), trenutno vključujeta BA.2.75, BA.2.86 in rekombinantne različice XBB. Tabela 1 prikazuje število posameznih primerov VOI / VUM, vključujoč podrazličice, dokazanih pri nas.
Tabela 1: Prikaz števila posameznih različic VOI / VUM dokazanih na IMI do vključno 12. 11. 2023.
| Različica† (VOI/VUM) | Teden prve potrditve | Kumulativno število primerov | Dokazana v zadnjem presejalnem obdobju |
| XBB.1.5 (VOI) | 50/2022 | 394 | DA |
| XBB.1.16 (VOI) | 15/2023 | 193 | DA |
| EG.5 (VOI) | 30/2023 | 194 | DA |
| BA.2.75‡ (VUM) | 27/2022 | 32 | DA (DV.7) |
| CH.1.1 (VUM) | 46/2022 | 125 | NE |
| XBB‡ (VUM) | 43/2022 | 74 | DA |
| XBB.1.9.1 (VUM) | 04/2023 | 305 | DA |
| XBB.1.9.2‡ (VUM) | 08/2023 | 147 | DA |
| XBB.2.3 (VUM) | 13/2023 | 75 | DA |
| BA.2.86 (VUM) | 39/2023 | 9 | DA |
| † – vključujoč hčerinske različice, ‡ – brez tistih hčerinskih različic, ki se posebej spremljajo kot VOI / VUM | |||
