V stosedemindvajseto presejalno sekveniranje virusnih različic SARS-CoV-2 z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekveniranje) smo vključili 18 vzorcev (95 % vseh SARS-CoV-2 PCR-pozitivnih vzorcev na IMI), ki so bili odvzeti med 07. 08. 2023 in 20. 08. 2023. Izmed teh je bilo 67 % vzorcev iz Osrednjeslovenske regije, 11 % iz Obalno-kraške regije in po 6 % iz Gorenjske ter Savinjske regije. Dva vzorca sta pripadala osebama, ki imata stalno prebivališče v tujini.
Zaradi stabilne epidemiološke situacije, ECDC od 3. marca 2023 na seznam zaskrbljujočih variant (»Variants of Concern« – VOC) trenutno ne uvršča nobenih linij SARS-CoV-2.
V stosedemindvajsetem presejalnem obdobju, tedna 32/2023 in 33/2023, smo različico omikron potrdili v vseh vzorcih.
Slika 1. Razporeditev posameznih genetskih različic omikrona dokazanih v 32. in 33. tednu 2023. Zunanji obroč prikazuje posamezne dokazane različice z izpisom imena tistih, ki so bile prisotne v deležu ³ 1 %. Notranji obroč prikazuje starševsko linijo. Kategorija RKM predstavlja delež različic nastalih z rekombinacijo.
Slika 2. Delež posameznih podrazličic omikrona potrjenih v celotnem obdobju presejalnega testiranja od pojava B.1.1.529 v Sloveniji dalje.
Nadzor nad potencialno nevarnejšimi različicami (»VOI« / »VUM«)
WHO in ECDC med različice, ki se podrobneje spremljajo (»Variants Of Interest« – VOI; »Variants Under Monitoring« – VUM), trenutno vključujeta BA.2.75, BA.2.86 in rekombinantne različice XBB. Tabela 1 prikazuje število posameznih primerov VOI / VUM, vključujoč podrazličice, dokazanih pri nas.
Tabela 1: Prikaz števila posameznih različic VOI / VUM dokazanih na IMI do vključno 20. 08. 2023.
Različica† (VOI/VUM) | Teden prve potrditve | Kumulativno število primerov | Dokazana v zadnjem presejalnem obdobju |
XBB.1.5 (VOI) | 50/2022 | 351 | DA |
XBB.1.16 (VOI) | 15/2023 | 52 | DA (FU.2.1) |
EG.5 (VOI) | 30/2023 | 7 | DA |
BA.2.75‡ (VUM) | 27/2022 | 16 | NE |
CH.1.1 (VUM) | 46/2022 | 125 | NE |
XBB‡ (VUM) | 43/2022 | 58 | NE |
XBB.1.9.1 (VUM) | 04/2023 | 196 | DA |
XBB.1.9.2 (VUM)‡ | 08/2023 | 89 | DA |
XBB.2.3 (VUM) | 13/2023 | 9 | NE |
BA.2.86 (VUM) | / | 0 | NE |
† – vključujoč hčerinske različice, ‡ – brez tistih hčerinskih različic, ki se posebej spremljajo kot VOI / VUM |