Laboratorij za diagnostiko COVID-19 (COV)

Vsi laboratoriji

Spremljanje različic SARS-CoV-2

V laboratoriju za dioagnostiko COVID-19 skrbimo tudi za sistematično genomsko opredeljevanje virusa SARS-CoV-2. V okviru laboratorija smo razvili izvirni algoritem presejanja virusih različic z metodo določanja nukleotidnih zaporedij (sekvenciranje). Algoritem nam omogoča hkratno zaznavo vseh pomembnih mutacij v različicah virusa in s tem sistematično spremljanje genomske raznolikosti virusa SARS-CoV-2 ter genomskega opredeljevanja različic virusa SARS-CoV-2, ki se širijo v Sloveniji.  S tem zagotovimo takojšnjo prilagoditev za presejanje novih kandidatnih klinično pomembnih mutacij.

Na IMI smo od začetka pandemije določili več kot 40.000 zaporedij SARS-CoV-2, podatki so prikazani v Preglednici 1, kar predstavlja polovico vseh virusnih zaporedij SARS-CoV-2 določenih v Sloveniji (Slika 1). Vsa pridobljena zaporedja so naložena v podatkovni bazi GISAID. Za posamezno obdobje sproti objavljamo strokovna POROČILA.

lab cov

Povezave

Poročila sistematičnega genomskega opredeljevanja in spremljanje epidemije SARS-CoV-2:

AKTUALNO POROČILO:
133. POROČILO IMI (23.10.-12.11.2023)

Predhodnja poročila:
132. POROČILO IMI (09.10.-22.10.2023)
131. POROČILO IMI (02.10.-08.10.2023)

ARHIV POROČIL

Sledenje različicam SARS-CoV-2 v Sloveniji izvaja tudi Nacionalni laboratorij za zdravje, okolje in hrano – NLZOH.